249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0833 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 259 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  98.84 
 
 		 259 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  90.35 
 
 		 259 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  90.73 
 
 		 259 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  90.73 
 
 		 259 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  89.58 
 
 		 278 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  87.64 
 
 		 292 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  78.86 
 
 		 247 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  78.05 
 
 		 245 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  78.05 
 
 		 245 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  77.64 
 
 		 245 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  78.05 
 
 		 245 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  78.05 
 
 		 245 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  78.05 
 
 		 245 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  78.05 
 
 		 245 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  63.89 
 
 		 266 aa  275  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  65.48 
 
 		 299 aa  255  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  64.68 
 
 		 252 aa  254  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  53.66 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  50.73 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  56.86 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  52.75 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  53.92 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  52.05 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  48.56 
 
 		 217 aa  199  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  51.83 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  52.2 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  53.04 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  54.65 
 
 		 218 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  53.41 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  54.29 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  53.59 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  55.62 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  48.24 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  48.5 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  47.65 
 
 		 182 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  43.02 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  44.89 
 
 		 211 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  45.29 
 
 		 178 aa  138  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  43.67 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  40.43 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  43.6 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  38.92 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  45.86 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  45.86 
 
 		 221 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  43.38 
 
 		 192 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  43.38 
 
 		 192 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  35.33 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  35.87 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  43.61 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  38.29 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  44.63 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  34.29 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  34.46 
 
 		 185 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  34.09 
 
 		 185 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  34.1 
 
 		 185 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  34.27 
 
 		 186 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  45.26 
 
 		 189 aa  95.9  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  32.95 
 
 		 186 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  37.5 
 
 		 181 aa  94  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  32.95 
 
 		 186 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  34.39 
 
 		 364 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  33.86 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  35.23 
 
 		 450 aa  92  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  45.51 
 
 		 178 aa  92  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  30.43 
 
 		 199 aa  90.5  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  32.96 
 
 		 186 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  31.4 
 
 		 180 aa  90.5  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2166  hypothetical protein  43.09 
 
 		 177 aa  89.4  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  32.39 
 
 		 186 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  35.8 
 
 		 180 aa  88.6  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  35.67 
 
 		 179 aa  87.8  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  35.84 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  32.54 
 
 		 225 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  33.14 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  30.11 
 
 		 180 aa  85.9  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 232 aa  85.9  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  32.02 
 
 		 185 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  36.31 
 
 		 179 aa  85.5  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1701  hypothetical protein  35.09 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  31.46 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  37.61 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  32.58 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  29.31 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  35.71 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  30.23 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  30.77 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  37.4 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1781  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  35.45 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1843  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1783  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.399196  normal  0.131762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1493  smr domain protein  33.33 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1675  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.377417  normal  0.101642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  33.51 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  29.07 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  29.07 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3019  hypothetical protein  32.94 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.862772  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  34.55 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  34.55 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>