More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6638 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.77 
 
 		 930 aa  687    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  45.2 
 
 		 886 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  45.13 
 
 		 913 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  44.87 
 
 		 939 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.86 
 
 		 880 aa  689    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 884 aa  1790    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  45.66 
 
 		 866 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  45.13 
 
 		 914 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  45.13 
 
 		 914 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.68 
 
 		 856 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.64 
 
 		 901 aa  625  1e-178  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  41.56 
 
 		 901 aa  627  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.2 
 
 		 867 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.6 
 
 		 850 aa  617  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.3 
 
 		 872 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.29 
 
 		 861 aa  610  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.27 
 
 		 1040 aa  607  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.7 
 
 		 852 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.45 
 
 		 852 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.34 
 
 		 963 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.21 
 
 		 866 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.53 
 
 		 870 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  41.53 
 
 		 870 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  39.1 
 
 		 865 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.39 
 
 		 890 aa  545  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.63 
 
 		 865 aa  542  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  38.39 
 
 		 866 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  38.39 
 
 		 861 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  39.42 
 
 		 833 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  38.34 
 
 		 866 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.63 
 
 		 851 aa  538  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  40.1 
 
 		 844 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  38.85 
 
 		 866 aa  535  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  40.88 
 
 		 842 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  38.66 
 
 		 888 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  37.26 
 
 		 866 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  37.68 
 
 		 866 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3974  putative outer membrane usher protein  38.14 
 
 		 866 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.183336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  40.54 
 
 		 868 aa  522  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.4 
 
 		 880 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  36.57 
 
 		 878 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  36.57 
 
 		 863 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  36.7 
 
 		 878 aa  497  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  36.57 
 
 		 878 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.45 
 
 		 878 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  36.82 
 
 		 856 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.44 
 
 		 887 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  38.21 
 
 		 872 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.31 
 
 		 929 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.27 
 
 		 863 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  36.27 
 
 		 854 aa  481  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38 
 
 		 840 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  36.27 
 
 		 854 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.93 
 
 		 883 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.68 
 
 		 876 aa  479  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.05 
 
 		 837 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  35.88 
 
 		 870 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  35.74 
 
 		 883 aa  476  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  35.98 
 
 		 839 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  35.88 
 
 		 870 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  35.76 
 
 		 870 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  35.6 
 
 		 870 aa  473  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.57 
 
 		 833 aa  470  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  36 
 
 		 870 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.02 
 
 		 875 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.02 
 
 		 875 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  35.16 
 
 		 875 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  35.89 
 
 		 866 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.59 
 
 		 871 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.89 
 
 		 866 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  36.22 
 
 		 839 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  36.01 
 
 		 866 aa  458  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  35.89 
 
 		 866 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.69 
 
 		 852 aa  459  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.05 
 
 		 869 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  35.64 
 
 		 866 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  34.93 
 
 		 869 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  36.04 
 
 		 866 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  35.05 
 
 		 869 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  34.93 
 
 		 869 aa  452  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  33.91 
 
 		 871 aa  452  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.37 
 
 		 867 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  35.6 
 
 		 809 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  36.02 
 
 		 833 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  35.52 
 
 		 866 aa  452  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3292  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.3 
 
 		 835 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249983 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  34.93 
 
 		 869 aa  452  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  35.6 
 
 		 809 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  35.9 
 
 		 850 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.43 
 
 		 844 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  36.21 
 
 		 842 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  35.6 
 
 		 809 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  35.6 
 
 		 809 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  36.21 
 
 		 842 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  35.48 
 
 		 809 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  35.04 
 
 		 869 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.02 
 
 		 838 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  36.09 
 
 		 842 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  35.15 
 
 		 863 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  35.15 
 
 		 838 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>