More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4495 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  85.16 
 
 		 384 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  85.16 
 
 		 384 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  85.16 
 
 		 384 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  91.93 
 
 		 384 aa  688    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  100 
 
 		 384 aa  770    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  85.16 
 
 		 384 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  85.16 
 
 		 384 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  91.93 
 
 		 384 aa  688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  94.01 
 
 		 384 aa  703    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  99.48 
 
 		 384 aa  766    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  85.16 
 
 		 384 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  84.38 
 
 		 414 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  85.16 
 
 		 384 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  91.93 
 
 		 384 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  91.93 
 
 		 384 aa  688    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  67.44 
 
 		 383 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  66.94 
 
 		 386 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  66.3 
 
 		 386 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  62.34 
 
 		 381 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  63.59 
 
 		 385 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  61.81 
 
 		 394 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  61.2 
 
 		 383 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  61.75 
 
 		 396 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  62.56 
 
 		 394 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  60.47 
 
 		 383 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  58.03 
 
 		 382 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  50.65 
 
 		 383 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  52.21 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  52.05 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  51.79 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  50.9 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  51.79 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  51.79 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  51.54 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  51.39 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  52.05 
 
 		 379 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  53.94 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  51.14 
 
 		 383 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  52.67 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  52.55 
 
 		 379 aa  359  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  51.41 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  51.83 
 
 		 374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  52.66 
 
 		 381 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  50.13 
 
 		 383 aa  350  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  50 
 
 		 382 aa  348  7e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  49.36 
 
 		 381 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  47.69 
 
 		 386 aa  342  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  49.2 
 
 		 379 aa  338  7e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  47.31 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  49.24 
 
 		 381 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  50 
 
 		 384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  49.26 
 
 		 384 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  49.26 
 
 		 384 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  49.26 
 
 		 384 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  49.26 
 
 		 384 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  49.26 
 
 		 384 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  49.26 
 
 		 384 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  49.49 
 
 		 381 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  47.89 
 
 		 380 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  49.01 
 
 		 384 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  49.62 
 
 		 377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  49.75 
 
 		 377 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  47.12 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  47.14 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  47.14 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  46.88 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  48.21 
 
 		 384 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  49.5 
 
 		 385 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  46.38 
 
 		 382 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  46.38 
 
 		 382 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  49.25 
 
 		 385 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  47 
 
 		 380 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  46.75 
 
 		 380 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  48.31 
 
 		 376 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  49.5 
 
 		 383 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  49.5 
 
 		 383 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  47.54 
 
 		 436 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  47.54 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  47.54 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  47.54 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  47.54 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  48.15 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  47.54 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  45.11 
 
 		 391 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  46.65 
 
 		 390 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  45.75 
 
 		 409 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  47 
 
 		 380 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  45.75 
 
 		 409 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  47.04 
 
 		 436 aa  306  6e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  47.29 
 
 		 386 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  49.25 
 
 		 383 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  46.25 
 
 		 375 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  45.66 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  46.51 
 
 		 375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  46.75 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  46.84 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.87 
 
 		 383 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  50.12 
 
 		 389 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  47.81 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  45.74 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>