76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1718 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  100 
 
 		 133 aa  273  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  48.78 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  52.38 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  46.97 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  50.79 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  45.33 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  53.19 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  47.17 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  43.86 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  43.86 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2438  group II intron, maturase-specific  37.04 
 
 		 338 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1119  group II intron, maturase-specific  37.04 
 
 		 338 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  41.27 
 
 		 635 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 634 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  41.27 
 
 		 635 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  38.64 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4548  HNH endonuclease  40.96 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.86 
 
 		 596 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  34.48 
 
 		 585 aa  47  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.67 
 
 		 648 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.67 
 
 		 648 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 282 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  40.3 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  35.62 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.86 
 
 		 607 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.86 
 
 		 607 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.86 
 
 		 607 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.86 
 
 		 607 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0227  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  43.55 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  45.83 
 
 		 627 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  45.83 
 
 		 627 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 221 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  40.91 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 299 aa  43.5  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  39.71 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  37.31 
 
 		 166 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 240 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  47.92 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0084  restriction endonuclease  38.46 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000299612  normal  0.866494 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4463  HNH endonuclease  30.16 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  35.48 
 
 		 587 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  40 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  38.6 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3259  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  42.55 
 
 		 842 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 253 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  37.31 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  32.56 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1305  HNH endonuclease  29.9 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.500836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  35.82 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.33 
 
 		 661 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 170 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1857  prophage LambdaSa2, HNH endonuclease family protein  33.33 
 
 		 119 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4619  HNH endonuclease  30.16 
 
 		 143 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  29.79 
 
 		 173 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 172 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1185  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  31.46 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  32.56 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0453  hypothetical protein  34.55 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0100448  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  38.46 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  30.14 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4737  RNA-directed DNA polymerase  56.67 
 
 		 33 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0267204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  30.69 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1766  hypothetical protein  41.1 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  32.31 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  35.82 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  37.7 
 
 		 309 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3540  HNH endonuclease  39.66 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  28.71 
 
 		 119 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>