17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3540 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3540  HNH endonuclease  100 
 
 		 163 aa  331  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4083  HNH endonuclease  48.7 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0644  HNH endonuclease  52 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0288065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5070  HNH endonuclease  48.54 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1606  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.982514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8187  HNH endonuclease  43 
 
 		 276 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0765  HNH endonuclease  41.53 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1857  prophage LambdaSa2, HNH endonuclease family protein  37.66 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  24.51 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2634  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 110 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8234  HNH endonuclease  32.18 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0543214  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  26.47 
 
 		 116 aa  42.4  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3594  HNH endonuclease  26.14 
 
 		 111 aa  41.2  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  33.82 
 
 		 89 aa  41.2  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  33.82 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  33.82 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  39.66 
 
 		 133 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>