More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0103 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  100 
 
 
411 aa  829    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  75.79 
 
 
380 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  75.79 
 
 
380 aa  594  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  75.79 
 
 
380 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  76.05 
 
 
380 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  75.79 
 
 
380 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  76.05 
 
 
380 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  75.53 
 
 
379 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  64.42 
 
 
384 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  64.42 
 
 
384 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  64.42 
 
 
384 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  64.68 
 
 
384 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  64.68 
 
 
384 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  64.42 
 
 
384 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  63.9 
 
 
384 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  59.23 
 
 
390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  60.52 
 
 
383 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  58.59 
 
 
383 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  60.16 
 
 
383 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  59.43 
 
 
391 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  59.23 
 
 
409 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  50.51 
 
 
379 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  50.51 
 
 
379 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  50.51 
 
 
379 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  50.25 
 
 
379 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  50.51 
 
 
379 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  50.25 
 
 
379 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  51.27 
 
 
383 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  52.25 
 
 
379 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  51.7 
 
 
374 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  50.76 
 
 
383 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  49.62 
 
 
381 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  51.21 
 
 
380 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  50.94 
 
 
380 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  47.46 
 
 
381 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  48 
 
 
381 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  48.99 
 
 
381 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  47.86 
 
 
384 aa  328  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  50.25 
 
 
384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  47.86 
 
 
383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  48.24 
 
 
383 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  49.09 
 
 
379 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  47.15 
 
 
375 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  46.89 
 
 
375 aa  309  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  45.98 
 
 
383 aa  309  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  47.52 
 
 
392 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  46.37 
 
 
375 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  46.37 
 
 
375 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  47 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  45.89 
 
 
391 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  46.95 
 
 
375 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  44.66 
 
 
409 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  44.66 
 
 
409 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  43.86 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  43.86 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  43.86 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  43.86 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  42.17 
 
 
383 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  43.86 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  43.86 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  43.86 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  43.11 
 
 
376 aa  288  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  45.21 
 
 
385 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  43.11 
 
 
414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  42.78 
 
 
381 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  41.91 
 
 
396 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  44.13 
 
 
384 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  47.04 
 
 
377 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  43.69 
 
 
383 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  43.59 
 
 
386 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  42.86 
 
 
394 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  46.09 
 
 
363 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  46.92 
 
 
377 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  46.17 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  46.17 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  43.01 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  46.04 
 
 
374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  46.17 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  46.17 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  42.86 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  46.04 
 
 
374 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  43.34 
 
 
384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  43.34 
 
 
384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  43.34 
 
 
384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  43.07 
 
 
386 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  45.78 
 
 
374 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  42.55 
 
 
386 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  43.65 
 
 
384 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  43.39 
 
 
384 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  42.51 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  46.49 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  45.52 
 
 
374 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  44.53 
 
 
383 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  46.4 
 
 
361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  44.02 
 
 
383 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  45.55 
 
 
362 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  45.55 
 
 
362 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  45.55 
 
 
362 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  44.27 
 
 
383 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  44.27 
 
 
383 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>