More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0129 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3159  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  100 
 
 
398 aa  811    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0524  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  99.5 
 
 
398 aa  808    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.413628  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0709  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  99.25 
 
 
398 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2887  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  100 
 
 
398 aa  811    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0542  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  99.5 
 
 
398 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1459  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  100 
 
 
398 aa  811    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0129  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  100 
 
 
398 aa  811    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7422  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  52.7 
 
 
391 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0466713  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6504  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  53.21 
 
 
391 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.828947 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6139  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  53.96 
 
 
391 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6013  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  53.21 
 
 
391 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000590386  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5648  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  53.21 
 
 
391 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597007  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  30.28 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.53 
 
 
414 aa  93.6  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  26.46 
 
 
416 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8366  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.74 
 
 
392 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.56 
 
 
411 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.32 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2972  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.53 
 
 
362 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980745 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.89 
 
 
430 aa  87.4  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.67 
 
 
412 aa  87  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.7 
 
 
388 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  29.43 
 
 
878 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.57 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.82 
 
 
404 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.06 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4867  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.15 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155396  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0262  diaminopimelate decarboxylase  26.43 
 
 
464 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.45 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.82 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  27.2 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4736  diaminopimelate decarboxylase  24.85 
 
 
463 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.775184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.68 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  25.71 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0658  diaminopimelate decarboxylase  25.69 
 
 
454 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  27.82 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  27.2 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.25 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0041  diaminopimelate decarboxylase  26.09 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.437243  hitchhiker  0.00781145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.06 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0274  ornithine decarboxylase  27.17 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000805907  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  26.63 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14901  diaminopimelate decarboxylase  25.81 
 
 
454 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.813083  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  24.37 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1629  diaminopimelate decarboxylase  26.88 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46186  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.94 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1416  ornithine decarboxylase  25 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  24.74 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  26.7 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  26.08 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  24.24 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  24.09 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.89 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.45 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.46 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  27.79 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0510  diaminopimelate decarboxylase  26.67 
 
 
434 aa  69.7  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  25.19 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  25.97 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.43 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1375  ornithine decarboxylase  28.43 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291612  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  27.11 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  23.96 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  24.28 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  25.53 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  24.66 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  27.11 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1908  diaminopimelate decarboxylase  27.11 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  26.55 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4020  diaminopimelate decarboxylase  25.58 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  24.69 
 
 
416 aa  67  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  27.23 
 
 
415 aa  67  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10961  diaminopimelate decarboxylase  26.67 
 
 
455 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297348  normal  0.231621 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  23.66 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  27.81 
 
 
394 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  25 
 
 
422 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.42 
 
 
409 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0534  diaminopimelate decarboxylase  26.35 
 
 
434 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  25.82 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1109  pyridoxal-dependent family decarboxylase  22.41 
 
 
389 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0406  diaminopimelate decarboxylase  26.7 
 
 
445 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809401  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0912  diaminopimelate decarboxylase  24.64 
 
 
464 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  25.82 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  25.82 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09931  diaminopimelate decarboxylase  28.64 
 
 
455 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.62 
 
 
428 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0790  diaminopimelate decarboxylase  28.04 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.867864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3116  diaminopimelate decarboxylase  28.88 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0675356 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  25.81 
 
 
425 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.59 
 
 
417 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  26.75 
 
 
417 aa  64.3  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  27.02 
 
 
422 aa  63.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.5 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  24.87 
 
 
445 aa  63.9  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  25.45 
 
 
402 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  25.37 
 
 
435 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.4 
 
 
400 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.4 
 
 
400 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  27.61 
 
 
414 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  25.65 
 
 
421 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.788055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>