93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A3009 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A3009  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  239  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2275  helix-turn-helix, AraC type  100 
 
 		 129 aa  239  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1080  hypothetical protein  98.21 
 
 		 56 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2415  AraC family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 344 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1803  AraC family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 362 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5742  AraC family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 344 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2419  AraC family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 344 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2460  AraC family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 344 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2325  AraC family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 344 aa  84.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 335 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 345 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 343 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  37.74 
 
 		 346 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 333 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 345 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 345 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 345 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 345 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3149  helix-turn-helix domain-containing protein  39.02 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0282952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 364 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3400  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 274 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.558312  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 343 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0031  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 247 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 295 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 335 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 351 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 352 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05257  hypothetical protein  28.57 
 
 		 332 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 352 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 343 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 342 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 373 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1486  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 352 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.193369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  35.85 
 
 		 346 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4563  transcriptional regulator, AraC family  33.72 
 
 		 284 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5762  transcriptional regulator, AraC family  40.54 
 
 		 337 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 289 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4301  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0066  AraC family transcription regulator  30.11 
 
 		 265 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0603708  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4267  AraC family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 333 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1953  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 268 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209316  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4935  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 319 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 291 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 327 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1252  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 336 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 338 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 361 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  41.56 
 
 		 352 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 346 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 342 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  30.23 
 
 		 337 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 345 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 332 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 345 aa  42  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0654  HTH-type regulatory protein, AraC family  28.71 
 
 		 265 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2480  transcriptional regulator, AraC family  40.85 
 
 		 336 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2910  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 340 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.659583  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 363 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  32.93 
 
 		 352 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 357 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  34.72 
 
 		 347 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1157  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.220941  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1123  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.14002e-21 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2361  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 335 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 341 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 340 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 340 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.78 
 
 		 321 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 347 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 336 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 336 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1040  regulatory protein  36.62 
 
 		 262 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.907674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1145  regulatory protein  36.62 
 
 		 262 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103899  normal  0.251225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1191  regulatory protein  36.62 
 
 		 262 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 346 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 277 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  41.33 
 
 		 327 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 351 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1647  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 237 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2560  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 344 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 343 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 342 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 346 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 343 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  39.02 
 
 		 366 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  49.09 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 366 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5362  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 348 aa  40  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  0.226827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  25.61 
 
 		 337 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 307 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>