180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1527 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  100 
 
 		 444 aa  886    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  55.08 
 
 		 460 aa  484  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2711  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.309074  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1383  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 439 aa  94.4  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.88 
 
 		 460 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.88 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.29 
 
 		 469 aa  89.7  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  28.61 
 
 		 436 aa  86.7  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.68 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.22 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  22.59 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  26.02 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  19.89 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  22.95 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  24.5 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  21.75 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  24 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  25.41 
 
 		 468 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.35 
 
 		 465 aa  69.7  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1592  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.64 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00442608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  22.45 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.33 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.08 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 468 aa  67  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.36 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.86 
 
 		 471 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  26.58 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  24.3 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  24.12 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  24.37 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  21.29 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  23.78 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  24.22 
 
 		 625 aa  62.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  25.65 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  25 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  22.63 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  23.18 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  25 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  26.39 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  35.58 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  24.26 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  24.12 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  25.22 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  25.22 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  23.91 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  22.41 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  25.22 
 
 		 479 aa  59.7  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  21.51 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  21.51 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  21.51 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2853  sugar transporter  25.28 
 
 		 485 aa  59.7  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.563006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  24.78 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  21.51 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.22 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.16 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  25.22 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.79 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  25.22 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  25.22 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  21.51 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  27.87 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0781581 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  24.26 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0997  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  31.75 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281913  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0430  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  20.23 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  24.24 
 
 		 480 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  20.94 
 
 		 465 aa  57  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.79 
 
 		 478 aa  57  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  22.71 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  24.78 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  20.05 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.38 
 
 		 477 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.49 
 
 		 544 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 493 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0685  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  29.03 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000328828 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  21.13 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  22.98 
 
 		 460 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0789  glucuronide transporter  24.64 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  21.13 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  21.13 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.92 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  21.11 
 
 		 457 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  21.11 
 
 		 457 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  22.98 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  21.13 
 
 		 457 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>