More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0231 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
285 aa  586  1e-166  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  60.28 
 
 
284 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  59.22 
 
 
284 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  58.51 
 
 
284 aa  363  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  58.51 
 
 
284 aa  362  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  58.51 
 
 
284 aa  362  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  58.16 
 
 
284 aa  361  8e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  57.8 
 
 
283 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  57.09 
 
 
283 aa  352  5e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  57.09 
 
 
283 aa  352  5e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  57.09 
 
 
283 aa  352  5e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  57.09 
 
 
283 aa  351  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  56.69 
 
 
284 aa  351  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  56.69 
 
 
284 aa  350  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  57.09 
 
 
283 aa  350  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  57.09 
 
 
283 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  57.09 
 
 
283 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  57.09 
 
 
283 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  58.51 
 
 
284 aa  349  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  56.34 
 
 
284 aa  348  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  59.57 
 
 
284 aa  347  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  56.34 
 
 
284 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  55.99 
 
 
284 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  54.93 
 
 
284 aa  328  9e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 
300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  51.77 
 
 
301 aa  301  7.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 
293 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 
287 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  48.74 
 
 
287 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
283 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  48.01 
 
 
287 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 
283 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 
287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  45.55 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 
283 aa  282  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
286 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  47.65 
 
 
289 aa  281  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 
283 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 
283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  45.42 
 
 
283 aa  272  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 
284 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 
285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  44.93 
 
 
286 aa  261  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 
281 aa  259  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  48.73 
 
 
293 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 
281 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 
281 aa  258  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  44.68 
 
 
286 aa  258  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 
281 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 
281 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 
281 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  43.68 
 
 
281 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 
282 aa  256  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  45.3 
 
 
288 aa  255  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  44.04 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  47.2 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  44.01 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  44.6 
 
 
283 aa  252  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  42.91 
 
 
283 aa  252  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  42.55 
 
 
286 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  44.77 
 
 
281 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 
287 aa  250  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  44.77 
 
 
281 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  44.04 
 
 
281 aa  249  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  44.48 
 
 
281 aa  249  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 
280 aa  249  4e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 
280 aa  249  5e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  41.88 
 
 
281 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  43.32 
 
 
282 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 
285 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  43.36 
 
 
282 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 
287 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  43.88 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 
286 aa  243  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 
285 aa  242  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  40.78 
 
 
284 aa  242  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  42.24 
 
 
281 aa  242  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
309 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 
285 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  42.5 
 
 
283 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  43.11 
 
 
286 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  42.86 
 
 
289 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  42.39 
 
 
285 aa  235  7e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  40.29 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  43.46 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  43.21 
 
 
282 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 
283 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 
293 aa  229  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  40.85 
 
 
282 aa  229  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  43.11 
 
 
327 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 
290 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  42.24 
 
 
280 aa  229  6e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 
282 aa  228  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  43.11 
 
 
289 aa  228  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 
293 aa  228  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  42.21 
 
 
283 aa  227  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  39.65 
 
 
284 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>