More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2742 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  100 
 
 
371 aa  758    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  97.3 
 
 
371 aa  740    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  97.3 
 
 
371 aa  739    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  97.04 
 
 
371 aa  738    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  98.65 
 
 
371 aa  750    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  96.23 
 
 
371 aa  735    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  97.3 
 
 
371 aa  740    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  95.42 
 
 
371 aa  730    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  84.37 
 
 
373 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  97.57 
 
 
371 aa  742    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  96.23 
 
 
371 aa  736    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  69.27 
 
 
374 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  64.05 
 
 
375 aa  498  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  47.95 
 
 
371 aa  346  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  44.97 
 
 
371 aa  288  8e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  37.7 
 
 
367 aa  245  8e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  38.5 
 
 
363 aa  233  5e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0188  FAD dependent oxidoreductase  44.63 
 
 
380 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.887396  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 
375 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2101  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 
372 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2067  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  32.22 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  28.18 
 
 
367 aa  143  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  31.4 
 
 
364 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  29.23 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  29.75 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.06 
 
 
367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  29.11 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
366 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.55 
 
 
378 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  28.69 
 
 
363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 
363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.81 
 
 
374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 
365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.25 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
365 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  26.65 
 
 
365 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  27.97 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  29.3 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.17 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.33 
 
 
376 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3051  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
366 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0899897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.94 
 
 
417 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.94 
 
 
417 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  28.45 
 
 
404 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  30.03 
 
 
375 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
376 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  28.49 
 
 
361 aa  107  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
393 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  28.88 
 
 
391 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  28.12 
 
 
375 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  27.6 
 
 
368 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.83 
 
 
369 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  27.07 
 
 
393 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.58 
 
 
369 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.28 
 
 
369 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
360 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.77 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  29.75 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3277  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 
367 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
395 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  28.49 
 
 
371 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  24.8 
 
 
368 aa  97.4  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 
419 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 
440 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25.21 
 
 
369 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  27.76 
 
 
372 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  28.75 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  28.42 
 
 
392 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  27.65 
 
 
367 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  24.65 
 
 
369 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  24.65 
 
 
369 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
361 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.53 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 
376 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
817 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 
652 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  28.44 
 
 
368 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.23 
 
 
369 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  23.74 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.23 
 
 
369 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
389 aa  89.4  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.43 
 
 
415 aa  89.4  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 
816 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  22.35 
 
 
372 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  27.84 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
816 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  29.27 
 
 
1033 aa  87.4  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  29.07 
 
 
376 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 
415 aa  87  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>