More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1135 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  97.03 
 
 		 777 aa  520  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  92.22 
 
 		 778 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  95.91 
 
 		 777 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  95.54 
 
 		 777 aa  511  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  95.13 
 
 		 776 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  94.76 
 
 		 776 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  95.13 
 
 		 776 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  93.63 
 
 		 776 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  91.11 
 
 		 778 aa  484  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  49.42 
 
 		 780 aa  275  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  51.18 
 
 		 768 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  40.23 
 
 		 785 aa  211  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  38.15 
 
 		 768 aa  198  9e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  40.82 
 
 		 787 aa  195  8.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  39.68 
 
 		 753 aa  185  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  38.4 
 
 		 764 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  34.12 
 
 		 748 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  36.5 
 
 		 762 aa  168  9e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  38.65 
 
 		 772 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  35.02 
 
 		 702 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  33.73 
 
 		 702 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  35.8 
 
 		 689 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  35.55 
 
 		 689 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  35.41 
 
 		 689 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  35.55 
 
 		 689 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  35.02 
 
 		 689 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  35.41 
 
 		 691 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  35.16 
 
 		 689 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  35.02 
 
 		 689 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  35.02 
 
 		 691 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  35.97 
 
 		 691 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  29.81 
 
 		 760 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  30.52 
 
 		 755 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  32.81 
 
 		 712 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  33.05 
 
 		 706 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  32.63 
 
 		 706 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.4 
 
 		 763 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.02 
 
 		 763 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.52 
 
 		 706 aa  103  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.69 
 
 		 698 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.55 
 
 		 736 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  27.71 
 
 		 703 aa  99.4  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.44 
 
 		 716 aa  95.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0864  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.19 
 
 		 703 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  27.06 
 
 		 663 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2914  hypothetical protein  27.27 
 
 		 658 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0827  superfamily I DNA/RNA helicase  26.64 
 
 		 737 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  30.13 
 
 		 666 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5216  superfamily I DNA/RNA helicase  27.34 
 
 		 722 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0878  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.87 
 
 		 704 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.4 
 
 		 710 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0874  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.87 
 
 		 704 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  27.55 
 
 		 692 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  28.88 
 
 		 765 aa  72.4  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.24 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  26.01 
 
 		 680 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  28.57 
 
 		 717 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  28.32 
 
 		 795 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.32 
 
 		 767 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  28.7 
 
 		 679 aa  68.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.55 
 
 		 705 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.94 
 
 		 813 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  26.36 
 
 		 754 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2668  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.31 
 
 		 629 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  25 
 
 		 615 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  26.75 
 
 		 742 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  25.27 
 
 		 815 aa  65.9  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.57 
 
 		 747 aa  65.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  27.27 
 
 		 719 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  27.07 
 
 		 852 aa  65.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.95 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.69 
 
 		 670 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.4 
 
 		 755 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  26.64 
 
 		 742 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  25.32 
 
 		 799 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  25.44 
 
 		 695 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  25.1 
 
 		 1048 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  33.86 
 
 		 702 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  24.81 
 
 		 752 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  26.69 
 
 		 727 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1567  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.48 
 
 		 629 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  30.06 
 
 		 723 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  27.8 
 
 		 685 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.77 
 
 		 786 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24 
 
 		 861 aa  58.9  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.37 
 
 		 724 aa  58.9  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  30.72 
 
 		 728 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  23.57 
 
 		 695 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  30.12 
 
 		 728 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  26.52 
 
 		 902 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  26.48 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  26.2 
 
 		 705 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0258  UvrD/REP helicase  33.06 
 
 		 685 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5901  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 689 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361362  normal  0.5857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0801  UvrD/REP helicase  31.01 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  30.12 
 
 		 728 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  30.05 
 
 		 653 aa  57.4  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  37.21 
 
 		 1089 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.54 
 
 		 686 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>