183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0827 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0827  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 737 aa  1403    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0878  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  97.59 
 
 		 704 aa  1173    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0864  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  76.25 
 
 		 703 aa  921    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0874  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  97.59 
 
 		 704 aa  1175    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  36.34 
 
 		 852 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2531  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.54 
 
 		 636 aa  174  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2914  hypothetical protein  27.46 
 
 		 658 aa  172  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2668  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.39 
 
 		 629 aa  171  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1567  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.37 
 
 		 629 aa  157  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  26.2 
 
 		 702 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.49 
 
 		 706 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  22.37 
 
 		 702 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  25.99 
 
 		 755 aa  92.8  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.47 
 
 		 698 aa  90.5  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  28.47 
 
 		 689 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  27.05 
 
 		 691 aa  90.5  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  27.84 
 
 		 691 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  28.4 
 
 		 768 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  28.19 
 
 		 778 aa  89  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  27.97 
 
 		 777 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  27.41 
 
 		 776 aa  87.8  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  30.84 
 
 		 666 aa  87.8  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  27.49 
 
 		 689 aa  87.4  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  27.49 
 
 		 689 aa  87.4  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 		 778 aa  87.4  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  27.08 
 
 		 689 aa  87  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  27.27 
 
 		 689 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.39 
 
 		 763 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  27.02 
 
 		 689 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  27.8 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.38 
 
 		 763 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  27.41 
 
 		 776 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  27.15 
 
 		 689 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  26.01 
 
 		 691 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  29.58 
 
 		 712 aa  84.3  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.81 
 
 		 736 aa  84.3  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  26.64 
 
 		 776 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  26.64 
 
 		 777 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  26.64 
 
 		 776 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  26.25 
 
 		 777 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  21.53 
 
 		 706 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  24.14 
 
 		 760 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  28.24 
 
 		 703 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  21.22 
 
 		 706 aa  77  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  28.81 
 
 		 792 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  23.73 
 
 		 780 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.77 
 
 		 813 aa  75.5  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  26.23 
 
 		 753 aa  74.7  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.04 
 
 		 695 aa  73.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.27 
 
 		 716 aa  72.8  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  29.02 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  29.71 
 
 		 706 aa  72.8  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  33.03 
 
 		 727 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  25 
 
 		 710 aa  72.4  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  25.69 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  26.05 
 
 		 748 aa  70.5  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  31.66 
 
 		 799 aa  70.1  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  24.26 
 
 		 564 aa  69.3  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  19.88 
 
 		 819 aa  68.2  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  27.34 
 
 		 762 aa  67.8  0.0000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  27.44 
 
 		 673 aa  64.7  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.29 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5216  superfamily I DNA/RNA helicase  25.56 
 
 		 722 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.29 
 
 		 861 aa  62  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  31.34 
 
 		 706 aa  61.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.83 
 
 		 659 aa  60.8  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.6 
 
 		 670 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  27.08 
 
 		 785 aa  59.3  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.34 
 
 		 724 aa  60.1  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.72 
 
 		 672 aa  58.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  30.67 
 
 		 754 aa  58.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  21.88 
 
 		 772 aa  57.8  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  29.82 
 
 		 776 aa  57  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  30.4 
 
 		 695 aa  57  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.47 
 
 		 768 aa  57  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  31.96 
 
 		 795 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  25.39 
 
 		 712 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  33.59 
 
 		 761 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  28.89 
 
 		 679 aa  56.2  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  29.31 
 
 		 690 aa  56.2  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.49 
 
 		 705 aa  56.6  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  29.9 
 
 		 692 aa  55.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  28.73 
 
 		 684 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  29.96 
 
 		 717 aa  55.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  26.53 
 
 		 687 aa  55.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  25.93 
 
 		 726 aa  54.7  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  27.07 
 
 		 768 aa  54.7  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  31.17 
 
 		 724 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  31.17 
 
 		 724 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.88 
 
 		 729 aa  53.5  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  26.65 
 
 		 702 aa  53.9  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  31.17 
 
 		 724 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  28.85 
 
 		 697 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 680 aa  53.9  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.55 
 
 		 699 aa  53.9  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  28.66 
 
 		 736 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  24.67 
 
 		 1048 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  30.14 
 
 		 705 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  29.17 
 
 		 742 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>