More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_4541 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  98.34 
 
 		 225 aa  366  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  98.34 
 
 		 225 aa  366  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  98.34 
 
 		 225 aa  366  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  97.79 
 
 		 225 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  97.79 
 
 		 225 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  97.24 
 
 		 225 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  93.92 
 
 		 225 aa  358  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  93.37 
 
 		 225 aa  357  6e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  93.92 
 
 		 225 aa  355  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  88.27 
 
 		 185 aa  335  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  71.35 
 
 		 226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  66.29 
 
 		 226 aa  254  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  56.74 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  53.93 
 
 		 236 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  52.25 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 230 aa  184  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1718  DNA repair protein RadC  51.1 
 
 		 184 aa  184  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1752  DNA repair protein RadC  51.1 
 
 		 184 aa  184  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.351254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  48.31 
 
 		 229 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  48.88 
 
 		 229 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  48.88 
 
 		 227 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  48.31 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  52.81 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  45.93 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  48.8 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1225  truncated DNA repair protein RadC  46.7 
 
 		 184 aa  167  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.247593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  53.93 
 
 		 227 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  47.54 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  47.65 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  47.75 
 
 		 232 aa  153  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  45.2 
 
 		 222 aa  152  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  45.76 
 
 		 228 aa  152  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  45.2 
 
 		 228 aa  152  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  46.02 
 
 		 227 aa  152  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  46.89 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  45.56 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  44.51 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  46.49 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  45.51 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  45.76 
 
 		 223 aa  150  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  43.82 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  45.83 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  45.81 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  44.69 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  42.37 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  46.15 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  42.94 
 
 		 223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  43.24 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1733  DNA repair protein RadC  39.78 
 
 		 239 aa  143  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.112707  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  41.24 
 
 		 223 aa  143  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  43.48 
 
 		 229 aa  143  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  41.34 
 
 		 228 aa  142  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  43.41 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  40.45 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  41.44 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  41.85 
 
 		 243 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  43.26 
 
 		 226 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  41.81 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  43.75 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  42.94 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  42.61 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  42.94 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 243 aa  138  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  45.29 
 
 		 222 aa  137  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  44.71 
 
 		 215 aa  137  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  40.91 
 
 		 224 aa  137  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  47.19 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  40.68 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  39.57 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  39.57 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  41.62 
 
 		 231 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  45.22 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  41.01 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  40.68 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  40.34 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  39.2 
 
 		 224 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  41.62 
 
 		 231 aa  134  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  41.11 
 
 		 224 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  39.41 
 
 		 224 aa  134  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  41.14 
 
 		 245 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  38.98 
 
 		 224 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1095  DNA repair protein RadC  41.76 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.912816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  46.07 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 229 aa  131  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  39.77 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  40.8 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  42.7 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  41.11 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  37.99 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  38.98 
 
 		 224 aa  128  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  40.22 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  50.43 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  42.01 
 
 		 228 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  36.41 
 
 		 243 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  40.34 
 
 		 224 aa  125  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3828  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 225 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.760529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  38.55 
 
 		 237 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5194  DNA repair protein RadC  40.22 
 
 		 235 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0102732  normal  0.30357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>