125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4848 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4848  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7169  hypothetical protein  60.2 
 
 		 200 aa  250  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1051  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.92 
 
 		 195 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4899  uncharacterized peroxidase-related enzyme  58.91 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05610  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  59.04 
 
 		 197 aa  219  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429163  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  58 
 
 		 472 aa  215  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  56 
 
 		 210 aa  205  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.22 
 
 		 377 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  49.49 
 
 		 372 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  49.5 
 
 		 371 aa  184  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.72 
 
 		 377 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.88 
 
 		 372 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  46.45 
 
 		 391 aa  159  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.03 
 
 		 398 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.16 
 
 		 369 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.62 
 
 		 369 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  40.89 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.34 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.99 
 
 		 197 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.99 
 
 		 197 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.86 
 
 		 386 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.47 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.09 
 
 		 196 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  43.16 
 
 		 196 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.6 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.55 
 
 		 196 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.86 
 
 		 197 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  44.32 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.32 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  43.01 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  41.94 
 
 		 197 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.3 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0666  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.59 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240929  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.8 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.99 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  30.54 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.46 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.61 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.09 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.94 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.23 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  34.75 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8777  peroxidase family protein  33.05 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  30.58 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.97 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.23 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.86 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.69 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.81 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.33 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2695  peroxidase-like  32.23 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.500229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  32.59 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 172 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  26.79 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  31.67 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.67 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.67 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  26.52 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  25.86 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9083  peroxidase family protein  33.05 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.86 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.08 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  27.03 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.45 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1739  hypothetical protein  26.43 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0852288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.98 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.25 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.17 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.93 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3875  peroxidase family protein  28.45 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0496445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.61 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  27.59 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  25.23 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.44 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.9 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  25.99 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.5 
 
 		 182 aa  48.5  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.38 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4078  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.51 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.201946  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.83 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.89 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  25.83 
 
 		 426 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  25.83 
 
 		 426 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.61 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.06 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  25.86 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.21 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.86 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.72 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  25.83 
 
 		 426 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.77 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.7 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.07 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.7 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.66 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  27.19 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  25.86 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>