154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4290 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  76.53 
 
 		 306 aa  317  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  75.51 
 
 		 196 aa  315  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  76.53 
 
 		 196 aa  291  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  65.31 
 
 		 196 aa  266  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  46.39 
 
 		 192 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  45.79 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  44.85 
 
 		 192 aa  167  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  43.81 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  44.33 
 
 		 192 aa  164  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  34.34 
 
 		 188 aa  95.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  36.17 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  35.19 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  29.26 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  29.23 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  32.12 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  28.1 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  29.87 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  32.81 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  29.07 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  31.74 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  26.06 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  26.8 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  29.83 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  28.35 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  30.96 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  28.72 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  29.02 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  32.33 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  29.14 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  31.91 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  27.59 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0308  flavoprotein  36.27 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  30.25 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  28.85 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  30.67 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  31.82 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  30.1 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  26.29 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  30.88 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  28.14 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  27.66 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  33.91 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  27.07 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  27.86 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  27.59 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  25.13 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  26.8 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  32.47 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  23.81 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  27.81 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  29.66 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  33.6 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  23.83 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  26.6 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  33.58 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.97 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  40.28 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  27.13 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  25.56 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  26.82 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  25.4 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  40.28 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  40.28 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  40.28 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  40.28 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  40.28 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  40.28 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  40.28 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  40.28 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  40.28 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  40.28 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  40.28 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  40.28 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  40.28 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  30.05 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1444  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.94 
 
 		 181 aa  48.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  28.76 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1726  NADPH-dependent FMN reductase  22.52 
 
 		 280 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>