187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3831 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3831  putative permease  100 
 
 		 389 aa  780    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  79.74 
 
 		 390 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  77.12 
 
 		 389 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  72.28 
 
 		 388 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  71.72 
 
 		 388 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  72.24 
 
 		 388 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  70.18 
 
 		 388 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  40.87 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  40 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  40 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  44.77 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  43.97 
 
 		 388 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  40.95 
 
 		 386 aa  269  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  39.95 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  33.24 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  33.51 
 
 		 416 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  30.85 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  31.04 
 
 		 402 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  30.85 
 
 		 402 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  32.68 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  30.33 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  31.63 
 
 		 393 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  31.02 
 
 		 393 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  32.47 
 
 		 373 aa  176  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  29.13 
 
 		 399 aa  162  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  30.38 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  31.35 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  29.24 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  30.58 
 
 		 382 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  30.92 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  28.45 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  27.48 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  27.48 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  27.63 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  29.36 
 
 		 371 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  29.05 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  29.36 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  26.59 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  25.51 
 
 		 380 aa  93.2  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  27.38 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  26.61 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  28.05 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  26.36 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.01 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.69 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  23.6 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  24.57 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  26.47 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.56 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  30.73 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.55 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  30.73 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  27.6 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  30.88 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  25.85 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  27.44 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  28.24 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  28.24 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  30.59 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  25.51 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  28.05 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  27.78 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  24.89 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  22.14 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.88 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  24.28 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  27.57 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  22.3 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  27.27 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  22.77 
 
 		 792 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  24.27 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  24.68 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  27.27 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  23.99 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  27.68 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  25.56 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  26.86 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  22.74 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  26.63 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  23.79 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  23.88 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  23.79 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  24.05 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  23.94 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  23.94 
 
 		 364 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  23.94 
 
 		 364 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  24.1 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  25.4 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0593  permease-like protein  24.46 
 
 		 386 aa  53.5  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.472296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  24.06 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  24.06 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>