More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26890 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  100 
 
 
314 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  74.19 
 
 
345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  73.08 
 
 
316 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  73.62 
 
 
316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  72.76 
 
 
316 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  72.64 
 
 
316 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  72.76 
 
 
316 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  72.44 
 
 
316 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  63.61 
 
 
327 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  64.92 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  62.66 
 
 
330 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  62.99 
 
 
330 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  63.4 
 
 
330 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  62.42 
 
 
330 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  63.07 
 
 
330 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  61.17 
 
 
320 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  63.07 
 
 
330 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  62.42 
 
 
328 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  62.66 
 
 
329 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  62.01 
 
 
329 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  61.11 
 
 
329 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  61.11 
 
 
329 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  61.11 
 
 
329 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  61.11 
 
 
329 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  60.87 
 
 
306 aa  355  5.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  56.17 
 
 
319 aa  355  5.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  60.13 
 
 
329 aa  352  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  56.82 
 
 
312 aa  352  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  58.17 
 
 
340 aa  348  7e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  56.13 
 
 
314 aa  345  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  56.45 
 
 
317 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  59.42 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  55.63 
 
 
315 aa  332  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  51.8 
 
 
319 aa  315  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.19 
 
 
320 aa  245  6.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  40 
 
 
313 aa  230  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.07 
 
 
270 aa  222  7e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.45 
 
 
320 aa  218  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  41.97 
 
 
317 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  38.31 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  40.89 
 
 
320 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  38.54 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  40 
 
 
344 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  41.07 
 
 
315 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  37.38 
 
 
339 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  35.88 
 
 
314 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  38.87 
 
 
301 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  37.99 
 
 
314 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  36.79 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  39.14 
 
 
318 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  37.21 
 
 
301 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  40.64 
 
 
321 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  39.61 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  35.35 
 
 
329 aa  145  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  40.89 
 
 
321 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  34.97 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  35.35 
 
 
311 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  36.77 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  36.51 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  32.14 
 
 
322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.26 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  37.09 
 
 
309 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.5 
 
 
323 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  34.15 
 
 
645 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  34.8 
 
 
311 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  33.77 
 
 
308 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  33.77 
 
 
308 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.95 
 
 
308 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  33.75 
 
 
320 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.95 
 
 
308 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.95 
 
 
308 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  34.57 
 
 
311 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  34.32 
 
 
308 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30.95 
 
 
323 aa  122  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.32 
 
 
308 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.75 
 
 
315 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  36.81 
 
 
320 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  33.21 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  30.26 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  35.81 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.85 
 
 
312 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 
317 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  33.95 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.37 
 
 
291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  28.66 
 
 
313 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  32.12 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  28.44 
 
 
628 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.6 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  33.95 
 
 
316 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  32.23 
 
 
308 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  24.92 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  34.08 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.69 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  28.75 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.1 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  33.22 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  33.54 
 
 
316 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.13 
 
 
315 aa  113  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  33.33 
 
 
325 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>