64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4045 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.88 
 
 		 634 aa  762    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  56.18 
 
 		 631 aa  714    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  60.38 
 
 		 633 aa  758    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  70.76 
 
 		 637 aa  890    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.7 
 
 		 612 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  80.23 
 
 		 631 aa  1026    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  70.55 
 
 		 637 aa  868    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.82 
 
 		 638 aa  739    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.54 
 
 		 637 aa  766    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.04 
 
 		 635 aa  760    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.05 
 
 		 647 aa  665    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  70.76 
 
 		 633 aa  889    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  63.05 
 
 		 630 aa  781    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  60.77 
 
 		 640 aa  761    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  63.08 
 
 		 636 aa  759    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  60.54 
 
 		 634 aa  751    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  80.73 
 
 		 633 aa  1058    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  59.68 
 
 		 644 aa  747    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.04 
 
 		 635 aa  760    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  63.53 
 
 		 632 aa  775    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  100 
 
 		 633 aa  1292    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  80.88 
 
 		 633 aa  1059    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.52 
 
 		 645 aa  760    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  60.94 
 
 		 631 aa  749    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.16 
 
 		 633 aa  742    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  59.97 
 
 		 631 aa  736    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  66.61 
 
 		 631 aa  840    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.97 
 
 		 632 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  54.02 
 
 		 620 aa  659    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  62.85 
 
 		 635 aa  765    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  54.32 
 
 		 619 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  52.06 
 
 		 624 aa  622  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  54.32 
 
 		 619 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  53.73 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  51.13 
 
 		 626 aa  612  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  52.18 
 
 		 625 aa  605  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  54.01 
 
 		 604 aa  607  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  54.32 
 
 		 622 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  52.85 
 
 		 619 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  49.69 
 
 		 633 aa  591  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  50.16 
 
 		 633 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  46.69 
 
 		 622 aa  514  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  32.98 
 
 		 563 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  32.41 
 
 		 577 aa  256  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  31.53 
 
 		 577 aa  230  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  30.88 
 
 		 574 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  31.71 
 
 		 578 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  31.14 
 
 		 610 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  30.11 
 
 		 573 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  38.08 
 
 		 573 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  27.58 
 
 		 582 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  30.74 
 
 		 788 aa  96.3  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  30.45 
 
 		 567 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  27.65 
 
 		 584 aa  93.6  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  20.55 
 
 		 572 aa  53.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  27.43 
 
 		 662 aa  52  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  24.47 
 
 		 628 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  24.47 
 
 		 628 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  26.7 
 
 		 533 aa  48.5  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  24.59 
 
 		 615 aa  47.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  25.37 
 
 		 599 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  23.01 
 
 		 584 aa  45.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  20.65 
 
 		 572 aa  45.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  25.62 
 
 		 629 aa  44.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>