More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3435 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0687  YidC/Oxa1 family lipolytic protein  89.03 
 
 
383 aa  704    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.852164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3435  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
380 aa  771    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98769  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0894  putative inner membrane protein translocase component YidC  66.49 
 
 
381 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4060  putative inner membrane protein translocase component YidC  65.96 
 
 
379 aa  534  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4099  putative inner membrane protein translocase component YidC  65.96 
 
 
379 aa  534  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5265  putative inner membrane protein translocase component YidC  63.8 
 
 
396 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.0483383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4710  putative inner membrane protein translocase component YidC  63.19 
 
 
382 aa  519  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1617  putative inner membrane protein translocase component YidC  58.99 
 
 
392 aa  488  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.281889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06091  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.94 
 
 
377 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16601  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.09 
 
 
382 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0685745  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0805  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.83 
 
 
382 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.792706  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1787  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.07 
 
 
380 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.169669  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12731  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.47 
 
 
383 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483232 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0577  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.26 
 
 
376 aa  421  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13871  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.49 
 
 
380 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0838115  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13581  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.37 
 
 
379 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.13065  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13791  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.44 
 
 
380 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.429072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1287  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.71 
 
 
380 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.495694  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.31 
 
 
533 aa  106  5e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  43.38 
 
 
225 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  40 
 
 
541 aa  103  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.86 
 
 
540 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  39.86 
 
 
540 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  39.37 
 
 
268 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  40 
 
 
541 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  42.19 
 
 
544 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  38.33 
 
 
543 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  44.25 
 
 
607 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  41.41 
 
 
545 aa  100  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  40 
 
 
632 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
554 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
554 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
543 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
544 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
548 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.28 
 
 
546 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.28 
 
 
546 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  41.41 
 
 
544 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.09 
 
 
600 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.69 
 
 
607 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
543 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.41 
 
 
541 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.28 
 
 
546 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.98 
 
 
553 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  43.55 
 
 
587 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.23 
 
 
578 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.23 
 
 
578 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  44.04 
 
 
257 aa  97.1  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
548 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
548 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
548 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
548 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.41 
 
 
575 aa  97.1  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
548 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  37.69 
 
 
559 aa  96.7  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.98 
 
 
543 aa  96.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  41.94 
 
 
584 aa  96.3  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.15 
 
 
610 aa  96.3  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.15 
 
 
610 aa  96.3  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.03 
 
 
555 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 
530 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.98 
 
 
545 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.06 
 
 
567 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  39.23 
 
 
614 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  39.84 
 
 
541 aa  95.9  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.58 
 
 
584 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
548 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  38.76 
 
 
548 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
548 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  38.76 
 
 
548 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  37.1 
 
 
584 aa  94.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
548 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
548 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 
629 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  41.03 
 
 
567 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.69 
 
 
621 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
548 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
548 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  40 
 
 
609 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  40.88 
 
 
261 aa  94.4  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  44.55 
 
 
542 aa  94.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  40.62 
 
 
541 aa  94.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
548 aa  94  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  38.46 
 
 
616 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.43 
 
 
555 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  38.46 
 
 
617 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  35 
 
 
553 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  35.04 
 
 
559 aa  94  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  35.94 
 
 
548 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 
526 aa  93.6  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  38.46 
 
 
616 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  37.5 
 
 
547 aa  93.6  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  36.72 
 
 
566 aa  93.6  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.92 
 
 
609 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  40.62 
 
 
562 aa  93.6  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.32 
 
 
560 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.32 
 
 
560 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.32 
 
 
560 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.32 
 
 
560 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.61 
 
 
528 aa  93.2  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>