More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0446 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  100 
 
 
324 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  76.73 
 
 
321 aa  518  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  59.33 
 
 
339 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  54.98 
 
 
336 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  50.57 
 
 
355 aa  364  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  50.28 
 
 
360 aa  363  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  50.92 
 
 
320 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  50.92 
 
 
320 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  48.77 
 
 
328 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  51.32 
 
 
315 aa  299  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  47.89 
 
 
276 aa  281  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  45.85 
 
 
275 aa  262  6e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  44.2 
 
 
270 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  46.76 
 
 
274 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  44.16 
 
 
270 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  43.93 
 
 
351 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  44.36 
 
 
291 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  42.91 
 
 
267 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  42.64 
 
 
267 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  43.18 
 
 
267 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  44.24 
 
 
267 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  33.82 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  33.56 
 
 
316 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.2 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  31.91 
 
 
298 aa  165  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 
302 aa  159  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  32.86 
 
 
344 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  33.59 
 
 
337 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  33.71 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  33.71 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  34.07 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5318  cytochrome c oxidase subunit II  30.4 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.2 
 
 
311 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3577  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.07 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 
316 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  30.83 
 
 
311 aa  129  6e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  30.24 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.43 
 
 
316 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  34 
 
 
362 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  29.76 
 
 
408 aa  122  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  32.16 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  30.43 
 
 
330 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  51.43 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  30.8 
 
 
302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  29.51 
 
 
301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  31.91 
 
 
318 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  33.48 
 
 
342 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  30.25 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  32.4 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  34.8 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  29.25 
 
 
426 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.03 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.83 
 
 
367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.06 
 
 
359 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  33.6 
 
 
362 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  27.43 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  30.29 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  32.93 
 
 
290 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  34.4 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  34.4 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 
399 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  48.11 
 
 
313 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  27.87 
 
 
318 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  30.15 
 
 
281 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  27.8 
 
 
269 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  35.03 
 
 
352 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  28.21 
 
 
260 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  27.76 
 
 
347 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  26.86 
 
 
387 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 
290 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  27.7 
 
 
358 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  38.6 
 
 
211 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1910  cytochrome c oxidase, subunit II  30.71 
 
 
334 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  27.46 
 
 
384 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  42.11 
 
 
314 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5670  cytochrome c oxidase subunit II  26.35 
 
 
373 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  29.92 
 
 
304 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  27.89 
 
 
304 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  27.98 
 
 
311 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  25.78 
 
 
523 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  45.05 
 
 
244 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  45.3 
 
 
326 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  43.4 
 
 
310 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  31.49 
 
 
289 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  29.7 
 
 
355 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  28.19 
 
 
353 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  27.27 
 
 
359 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 
388 aa  99.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  29.97 
 
 
373 aa  99.8  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  46.94 
 
 
271 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  26.84 
 
 
288 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  44.35 
 
 
338 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  28.31 
 
 
288 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  44.04 
 
 
351 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  44.44 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  28.2 
 
 
378 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  29.15 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  27.03 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  27.48 
 
 
377 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>