More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0558 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  51.03 
 
 
645 aa  670    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  50.08 
 
 
740 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  50.7 
 
 
645 aa  678    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  50.85 
 
 
645 aa  682    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4599  glycogen branching enzyme  50.85 
 
 
645 aa  682    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  50.95 
 
 
637 aa  677    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.42 
 
 
626 aa  727    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  50.56 
 
 
749 aa  650    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  50.85 
 
 
645 aa  682    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  51.63 
 
 
645 aa  688    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  55.29 
 
 
680 aa  731    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 
650 aa  1348    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4710  glycogen branching enzyme  52.21 
 
 
645 aa  693    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  50.85 
 
 
645 aa  681    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.03 
 
 
742 aa  663    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4980  glycogen branching enzyme  50.85 
 
 
645 aa  682    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  59 
 
 
630 aa  739    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  51.01 
 
 
645 aa  684    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0818  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.81 
 
 
674 aa  723    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.66 
 
 
728 aa  658    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  50.56 
 
 
725 aa  643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.84 
 
 
737 aa  713    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  51.1 
 
 
648 aa  667    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.76 
 
 
638 aa  728    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  50.71 
 
 
674 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  47.56 
 
 
766 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  48.56 
 
 
740 aa  629  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  48.83 
 
 
774 aa  629  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  48.08 
 
 
722 aa  630  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  48.82 
 
 
738 aa  628  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  47.89 
 
 
776 aa  627  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.97 
 
 
731 aa  625  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  48.36 
 
 
764 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  48.05 
 
 
764 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.48 
 
 
668 aa  622  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  50.72 
 
 
723 aa  623  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.52 
 
 
635 aa  624  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  47.19 
 
 
740 aa  619  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.33 
 
 
646 aa  615  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  47.58 
 
 
763 aa  617  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  49.04 
 
 
728 aa  618  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  48.64 
 
 
736 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  49.76 
 
 
726 aa  614  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.16 
 
 
732 aa  613  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.08 
 
 
631 aa  614  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.2 
 
 
631 aa  611  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  47.27 
 
 
782 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  47.27 
 
 
782 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.03 
 
 
654 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  47.34 
 
 
659 aa  608  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  48.48 
 
 
736 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.13 
 
 
621 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  48.16 
 
 
736 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2403  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.21 
 
 
659 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  47.89 
 
 
634 aa  607  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.21 
 
 
659 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  47.76 
 
 
748 aa  607  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1051  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.82 
 
 
670 aa  602  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.55 
 
 
646 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.91 
 
 
735 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  46.94 
 
 
728 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.64 
 
 
659 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  48 
 
 
736 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  46.53 
 
 
729 aa  604  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  46.71 
 
 
659 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  47.62 
 
 
695 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.12 
 
 
760 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  47.1 
 
 
728 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.2 
 
 
639 aa  601  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.91 
 
 
732 aa  601  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  46.61 
 
 
728 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  44.92 
 
 
785 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.2 
 
 
741 aa  598  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.32 
 
 
784 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  48.24 
 
 
746 aa  595  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  48.18 
 
 
725 aa  597  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.32 
 
 
784 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  47.28 
 
 
732 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.73 
 
 
785 aa  598  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  46.96 
 
 
732 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  44.65 
 
 
1320 aa  594  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  45.04 
 
 
765 aa  594  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  48.25 
 
 
625 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.43 
 
 
743 aa  594  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2229  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.24 
 
 
629 aa  593  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00541672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.09 
 
 
1217 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.78 
 
 
736 aa  592  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  44.64 
 
 
748 aa  590  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  45.91 
 
 
638 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  45.87 
 
 
756 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  48.18 
 
 
677 aa  590  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  46.4 
 
 
741 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.43 
 
 
726 aa  586  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  46.73 
 
 
733 aa  588  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  44.95 
 
 
1240 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.39 
 
 
770 aa  586  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2046  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.05 
 
 
730 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.026483  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.72 
 
 
741 aa  587  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17070  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  45.13 
 
 
654 aa  584  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  47.63 
 
 
642 aa  584  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>