169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3828 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  815    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  78.86 
 
 		 420 aa  590  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  54.9 
 
 		 438 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  54.09 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  50.93 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  49.29 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  54.01 
 
 		 434 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  51.61 
 
 		 440 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  54.3 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  50.86 
 
 		 441 aa  355  6.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  51.38 
 
 		 440 aa  350  3e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  51.9 
 
 		 439 aa  349  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  53.62 
 
 		 408 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  51.63 
 
 		 440 aa  347  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  52.79 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  47.47 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  55.09 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  47.46 
 
 		 456 aa  306  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  45.05 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  48.56 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 442 aa  292  7e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  54.59 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 464 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  38.84 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  44.95 
 
 		 307 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 427 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 397 aa  94.4  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  30 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  31.39 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 426 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  27.08 
 
 		 527 aa  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  26.7 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.45 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  20.59 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.1 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  27.19 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 474 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1496  permease  24.09 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  25.75 
 
 		 448 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  20.38 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 413 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  23.64 
 
 		 406 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 444 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  21.84 
 
 		 423 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  23.64 
 
 		 406 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 432 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1505  permease; multidrug resistance protein  23.64 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0948022  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  29.1 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.54 
 
 		 1833 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1717  hypothetical protein  23.64 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  28.65 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  24.58 
 
 		 686 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.37 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.73 
 
 		 408 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  22.27 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.46 
 
 		 408 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.46 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.46 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  25.57 
 
 		 688 aa  50.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1226  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.403066 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 415 aa  50.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  21.91 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  24.51 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  22.14 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  25.34 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 448 aa  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  30.77 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  21.82 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  21.18 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  25.38 
 
 		 688 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>