245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1542 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  90.34 
 
 		 238 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  52.32 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  45.63 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  50 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  45.65 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 248 aa  178  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  43.35 
 
 		 238 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  48.31 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  43.3 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  45.57 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 218 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  47.16 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  42.44 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  43.5 
 
 		 264 aa  155  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  39.59 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  41.52 
 
 		 258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  47.53 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  38.93 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  38.06 
 
 		 262 aa  134  9e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  37.39 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  34.23 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  38.86 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  63.16 
 
 		 422 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  57.95 
 
 		 313 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  29.65 
 
 		 287 aa  91.3  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 118 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 133 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 292 aa  52  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 129 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 129 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  48.28 
 
 		 154 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  36.52 
 
 		 129 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 150 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 128 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 128 aa  49.3  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  55 
 
 		 155 aa  48.9  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 273 aa  48.5  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 130 aa  48.5  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 144 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 97 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  36.78 
 
 		 145 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 97 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 149 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  36.26 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  31.62 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 164 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 126 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.19 
 
 		 134 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0004  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  44.93 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  41.46 
 
 		 137 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  44.93 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 164 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 164 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.19 
 
 		 134 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 164 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.27 
 
 		 135 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 142 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 154 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 129 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  31.4 
 
 		 148 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  50.91 
 
 		 147 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 		 157 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 138 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 129 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 129 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 132 aa  46.2  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  46.3 
 
 		 159 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 		 157 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 173 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 		 132 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  40.48 
 
 		 152 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  32.22 
 
 		 135 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  40.79 
 
 		 123 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 340 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 351 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 156 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 145 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 351 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 171 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>