More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1428 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1671  selenate reductase YgfK  50.24 
 
 
1009 aa  655    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1428  selenate reductase YgfK  100 
 
 
854 aa  1737    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  44.38 
 
 
991 aa  549  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  41.65 
 
 
997 aa  543  1e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1949  putative selenate reductase subunit YgfK  40.06 
 
 
1016 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02711  predicted oxidoreductase, Fe-S subunit  42.51 
 
 
1032 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0814  selenate reductase YgfK  42.66 
 
 
1032 aa  482  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3204  putative selenate reductase subunit YgfK  42.66 
 
 
1032 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4168  putative selenate reductase subunit YgfK  42.66 
 
 
1032 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3038  putative selenate reductase subunit YgfK  42.51 
 
 
1032 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02673  hypothetical protein  42.51 
 
 
1032 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0830  putative selenate reductase subunit YgfK  42.51 
 
 
1032 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3011  putative selenate reductase subunit YgfK  42.04 
 
 
1032 aa  480  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1495  hypothetical protein  51.14 
 
 
560 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  36.1 
 
 
1075 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2603  hypothetical protein  34.35 
 
 
698 aa  228  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.661586  normal  0.233906 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  28.68 
 
 
653 aa  95.9  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.73 
 
 
784 aa  93.2  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  29.63 
 
 
1412 aa  91.3  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  28.72 
 
 
546 aa  90.5  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.74 
 
 
776 aa  90.5  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  27.72 
 
 
493 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  28.88 
 
 
552 aa  89.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 
769 aa  89.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.05 
 
 
1406 aa  89.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  27.09 
 
 
541 aa  89.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  28.64 
 
 
1387 aa  88.6  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  27.48 
 
 
500 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  27.95 
 
 
577 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1406  glutamate synthase subunit beta  31.28 
 
 
479 aa  87  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  24.63 
 
 
461 aa  86.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  24.63 
 
 
461 aa  86.7  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  24.27 
 
 
494 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.49 
 
 
891 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.17 
 
 
1440 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  27.8 
 
 
571 aa  85.5  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.25 
 
 
895 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.04 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  26.8 
 
 
484 aa  83.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  22.26 
 
 
494 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.29 
 
 
914 aa  83.6  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1550  hypothetical protein  24.73 
 
 
788 aa  83.2  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  23.99 
 
 
502 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  27.02 
 
 
617 aa  82.4  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  31.13 
 
 
488 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  25.31 
 
 
494 aa  82  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  27.4 
 
 
612 aa  82  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  26.02 
 
 
616 aa  82  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.93 
 
 
1410 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  27.17 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  25.45 
 
 
502 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  25.45 
 
 
502 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  25.45 
 
 
502 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3439  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.2 
 
 
796 aa  81.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0609  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  23.83 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0291397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  24.4 
 
 
512 aa  81.6  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  25.09 
 
 
480 aa  81.3  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  25.3 
 
 
491 aa  81.3  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.05 
 
 
672 aa  81.3  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0014  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.46 
 
 
1116 aa  81.3  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.952368 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  25.1 
 
 
2126 aa  80.9  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  27.46 
 
 
654 aa  80.9  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  24.89 
 
 
501 aa  80.9  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  26.56 
 
 
579 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0247  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.1 
 
 
600 aa  80.5  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139263  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  27.57 
 
 
1385 aa  80.5  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  26.85 
 
 
495 aa  79.7  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  28.04 
 
 
486 aa  79.3  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  28.65 
 
 
487 aa  80.1  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  25.49 
 
 
492 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  27.84 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  27.23 
 
 
473 aa  79.3  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2164  glutamate synthase subunit beta  27.23 
 
 
473 aa  79.3  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0515227  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  23 
 
 
580 aa  79  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0301  putative oxidoreductase  27.89 
 
 
487 aa  79.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.456706 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  27.17 
 
 
578 aa  79.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  25.39 
 
 
472 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1200  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.1 
 
 
473 aa  79.3  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  27.65 
 
 
469 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  25.39 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  25.39 
 
 
674 aa  79  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  25.39 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  24.59 
 
 
495 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  24.59 
 
 
495 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  25 
 
 
688 aa  79  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.18 
 
 
1126 aa  79  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  24.1 
 
 
488 aa  79  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  26.56 
 
 
494 aa  78.6  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  26.23 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  24.59 
 
 
495 aa  78.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  23.94 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  25.49 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_131  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase protein  26.64 
 
 
677 aa  78.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000174101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  25.49 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_002936  DET0123  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  25 
 
 
643 aa  78.2  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0636906  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  28.87 
 
 
612 aa  77.8  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3749  glutamate synthase subunit beta  26.8 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  25.5 
 
 
481 aa  78.2  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  25.39 
 
 
472 aa  78.2  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  27.04 
 
 
612 aa  77.8  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>