258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0721 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  48.66 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  49.23 
 
 		 259 aa  245  6e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.79 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  35.69 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.55 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  36.14 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.25 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.71 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.76 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.85 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  31.87 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.6 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  31.64 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.71 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.68 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  29.92 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  30.71 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  32.03 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.81 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.51 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.14 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.55 
 
 		 268 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.77 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.19 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  27.49 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.16 
 
 		 257 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  29.08 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  29.08 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  29.08 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  29.08 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  29.08 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  29.08 
 
 		 247 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  29.08 
 
 		 247 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.52 
 
 		 293 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  28.69 
 
 		 247 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  28.69 
 
 		 247 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.08 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  29.06 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  28.29 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.71 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.81 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  30.65 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.96 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.2 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.41 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  29.92 
 
 		 249 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  28.12 
 
 		 248 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.17 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.52 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  28.12 
 
 		 248 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  28.52 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  28.57 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  28.57 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  28.57 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  30.77 
 
 		 254 aa  95.9  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0342  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.07 
 
 		 248 aa  95.9  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101989  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.83 
 
 		 242 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.68 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  26.04 
 
 		 243 aa  93.2  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  26.04 
 
 		 243 aa  93.2  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.15 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.69 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  27.84 
 
 		 243 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.89 
 
 		 238 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.64 
 
 		 236 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.02 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.56 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.2 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.31 
 
 		 261 aa  91.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.52 
 
 		 273 aa  89.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2172  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.51 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.991171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2261  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.51 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.315795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.22 
 
 		 248 aa  89  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  27.39 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0821  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.3 
 
 		 240 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1684  condensin subunit ScpA  30.33 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  27.39 
 
 		 272 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.2 
 
 		 285 aa  85.9  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.34 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  26.56 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.75 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.32 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1569  condensin subunit ScpA  29.41 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.729802  normal  0.82385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  26.48 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  27.94 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.32 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.15 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  29.48 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.92 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.27 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1751  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.41 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.133467  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.45 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  26.8 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.93 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1464  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.91 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1954  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.87 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  28.33 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>