More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0407 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0407  ABC transporter related  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0277  peptide ABC transporter ATPase  46.89 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2375  ABC transporter related  43.06 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  43.3 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  41.59 
 
 		 254 aa  165  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0952  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  44.55 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  42.13 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07029  ABC-type transporter ATPase component  43.84 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000979  ABC transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  39.17 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  40.93 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  40.54 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  40.99 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  44.39 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  41.24 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  39.81 
 
 		 261 aa  158  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1979  transporter  41.79 
 
 		 227 aa  158  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  42.58 
 
 		 250 aa  157  9e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  42.78 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  42.78 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  38.71 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  40.09 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  41.59 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  38.71 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  38.71 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  38.71 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  42.79 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  39.82 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  39.82 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  42.64 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3081  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.501337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1388  ABC transporter-related protein  42.44 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3083  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2199  ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 		 221 aa  154  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517578  hitchhiker  0.0000000011345 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1115  ABC transporter related  41.46 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1093  ABC transporter related  41.46 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000270909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  38.79 
 
 		 647 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  41.24 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  41.62 
 
 		 229 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  38.03 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0384  ABC transporter related protein  39.44 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  40.47 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  38.03 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  38.03 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  38.89 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  38.03 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  40.72 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2051  peptide ABC transporter ATPase  39.69 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 		 253 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0657  ABC transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  38.03 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.97 
 
 		 647 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.02 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  38.5 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  38.03 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  39.52 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4104  ABC transporter related  41.12 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0242374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  38.25 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  40.82 
 
 		 666 aa  151  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 288 aa  151  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  40.21 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0904  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  39.71 
 
 		 216 aa  151  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  38.46 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  38.97 
 
 		 247 aa  151  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  38.46 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  38.28 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0892  ABC transporter related  38.5 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.783252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13620  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  35.85 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  37.16 
 
 		 652 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0445  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.57 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.878124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  41.75 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  38.5 
 
 		 654 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  37.67 
 
 		 266 aa  149  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  41.24 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.79 
 
 		 678 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  38.79 
 
 		 678 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  38.76 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  38.79 
 
 		 678 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  37.56 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  40.49 
 
 		 234 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  39.29 
 
 		 239 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  39.8 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  42.05 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  37.85 
 
 		 656 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  38.89 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  38.14 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>