222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1402 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
370 aa  702    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  68.73 
 
 
371 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  68.46 
 
 
371 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  68.19 
 
 
371 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  32.39 
 
 
399 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  29.36 
 
 
418 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  32.41 
 
 
389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  31.22 
 
 
382 aa  159  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  33.7 
 
 
392 aa  143  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  28.49 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  28.89 
 
 
391 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  31.6 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  27.58 
 
 
397 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  27.67 
 
 
792 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  28.77 
 
 
391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  31.71 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  28.26 
 
 
380 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  29 
 
 
392 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  30.13 
 
 
384 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.09 
 
 
423 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  26.25 
 
 
379 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  30.66 
 
 
388 aa  90.5  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 
1040 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 
364 aa  89.7  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  20.99 
 
 
356 aa  89.4  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  24.74 
 
 
394 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  29.52 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  21.76 
 
 
417 aa  87  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  28.89 
 
 
388 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  28.53 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.62 
 
 
442 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  29.09 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  26.92 
 
 
389 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  26.5 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  26.5 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  27.48 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  24.17 
 
 
396 aa  79  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  23.72 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  25.16 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  25.96 
 
 
483 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  27.32 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  25.86 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  27.76 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  24.33 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  23.72 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  27.31 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  29.46 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  20.69 
 
 
403 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  22.17 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.49 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  29.55 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  25.73 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  27 
 
 
379 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  22.08 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  23.93 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  29.96 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  30.59 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  25.59 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  24.9 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.59 
 
 
434 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  26.8 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  24.51 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  25.14 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  26.39 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  26.71 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  26.39 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  28.76 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  27.88 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  26.39 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  28.46 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  20.18 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  22.49 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  27.52 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  30.21 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  24.35 
 
 
358 aa  67  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  24.61 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  26.82 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  23.02 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  27.51 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  23.4 
 
 
366 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  21.69 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  21.63 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  20.38 
 
 
441 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1183  permease YjgP/YjgQ  27.82 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.807963  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  23.7 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  21.83 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  27.15 
 
 
478 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.976143 
 
 
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NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 
370 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
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NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 
370 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal 
 
 
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NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  21.41 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  21.54 
 
 
392 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
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NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
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NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.45 
 
 
401 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.13 
 
 
442 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal 
 
 
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NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 
391 aa  63.5  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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