More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1859 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 311 aa  640    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  42.86 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  42.11 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  41.08 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  40.91 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  37.84 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  36.12 
 
 		 312 aa  205  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  35.35 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2276  2-dehydropantoate 2-reductase  37.28 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00122842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  36.08 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4006  2-dehydropantoate 2-reductase  34.59 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2074  2-dehydropantoate 2-reductase  35.96 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.136591  normal  0.0111283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1926  2-dehydropantoate 2-reductase  34.71 
 
 		 315 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000062548  hitchhiker  0.000000000000153659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  35.53 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  34.55 
 
 		 349 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00422056  hitchhiker  0.00254132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2549  2-dehydropantoate 2-reductase  35.49 
 
 		 317 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0215033  hitchhiker  0.00000000817655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2325  2-dehydropantoate 2-reductase  34.36 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79299  hitchhiker  0.0000420215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3556  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0552  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39578  predicted protein  31.37 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.51 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.55 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 		 329 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.42 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.5 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  32.08 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  34.72 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  34.26 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  34.26 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  32.41 
 
 		 341 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  33.8 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  26.33 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  25.9 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.18 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  30.48 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  30.33 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  27.46 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  32.87 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.67 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  30.38 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  27.1 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  27.53 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  30.06 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  28.85 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  27.84 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 		 324 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  27.03 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  32.7 
 
 		 336 aa  99.8  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.17 
 
 		 307 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 314 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  30.6 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 306 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  27.04 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  29.51 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  27.4 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 		 331 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  26.17 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 338 aa  97.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  27.81 
 
 		 307 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  27.07 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  26.86 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  26.17 
 
 		 335 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  26.17 
 
 		 335 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 		 327 aa  95.9  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  27.63 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  33.8 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  32.05 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  27.7 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  27.94 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  28.29 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3780  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  26.21 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4857  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 353 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  28.06 
 
 		 346 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  26.47 
 
 		 305 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  26.02 
 
 		 333 aa  92.8  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>