More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0956 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0956  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 683 aa  1376    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  47 
 
 		 986 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  46.33 
 
 		 882 aa  542  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  46.17 
 
 		 884 aa  542  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  46.83 
 
 		 980 aa  545  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  45.5 
 
 		 883 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  47.68 
 
 		 692 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  45.39 
 
 		 947 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  47.55 
 
 		 903 aa  533  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  46.27 
 
 		 845 aa  531  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2814  translation initiation factor IF-2  45.39 
 
 		 845 aa  526  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572575  hitchhiker  0.00404831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  45.73 
 
 		 732 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  46.14 
 
 		 924 aa  522  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  44.67 
 
 		 921 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  44.43 
 
 		 892 aa  520  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  45.32 
 
 		 853 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  44.46 
 
 		 907 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  45.04 
 
 		 975 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  45.04 
 
 		 975 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  43.19 
 
 		 890 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  44.87 
 
 		 975 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  44.87 
 
 		 975 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  45.04 
 
 		 975 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  45 
 
 		 985 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  44.87 
 
 		 975 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  44.87 
 
 		 848 aa  512  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  45.55 
 
 		 971 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  45.04 
 
 		 975 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  45.36 
 
 		 971 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  44.86 
 
 		 971 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  45.44 
 
 		 739 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  45.55 
 
 		 971 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  45.05 
 
 		 688 aa  512  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  44.86 
 
 		 972 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  45.03 
 
 		 972 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  43.56 
 
 		 1079 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  41.65 
 
 		 992 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  43.95 
 
 		 843 aa  510  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  43.9 
 
 		 979 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  44.78 
 
 		 986 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  44.87 
 
 		 969 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  43.7 
 
 		 912 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  44.76 
 
 		 686 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  45.13 
 
 		 868 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  44.76 
 
 		 686 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  44.58 
 
 		 964 aa  508  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  44.76 
 
 		 686 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  44.93 
 
 		 686 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  44.93 
 
 		 686 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  44.69 
 
 		 997 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  43.45 
 
 		 897 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  44.24 
 
 		 845 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  44.76 
 
 		 686 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  44.22 
 
 		 689 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  44.37 
 
 		 976 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  44.61 
 
 		 989 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  44.22 
 
 		 895 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  43.9 
 
 		 885 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  43.9 
 
 		 885 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  44.93 
 
 		 686 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  45.1 
 
 		 688 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  43.81 
 
 		 885 aa  505  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  43.96 
 
 		 964 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  43.28 
 
 		 984 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  44.39 
 
 		 873 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  44.2 
 
 		 880 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0667  translation initiation factor IF-2  45.72 
 
 		 826 aa  503  1e-141  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560866 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  43.96 
 
 		 964 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  43.36 
 
 		 679 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  43.36 
 
 		 679 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  42.97 
 
 		 881 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01303  translation initiation factor IF-2  42.36 
 
 		 904 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  44.54 
 
 		 889 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  45.76 
 
 		 970 aa  505  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  43.84 
 
 		 984 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  43.94 
 
 		 720 aa  501  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  44.15 
 
 		 822 aa  499  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  44.41 
 
 		 959 aa  502  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  43.12 
 
 		 705 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  43.12 
 
 		 705 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  44.35 
 
 		 917 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  44 
 
 		 949 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  42.17 
 
 		 943 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  43.94 
 
 		 965 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  43.85 
 
 		 896 aa  501  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  42.02 
 
 		 884 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  42.45 
 
 		 875 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  44.44 
 
 		 835 aa  500  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  43.96 
 
 		 686 aa  501  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  42.67 
 
 		 1008 aa  502  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  42.77 
 
 		 946 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  42.77 
 
 		 951 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  43.62 
 
 		 1058 aa  499  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  42.45 
 
 		 875 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  44.22 
 
 		 890 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  44.46 
 
 		 966 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  42.01 
 
 		 943 aa  497  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  44.22 
 
 		 890 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  43.87 
 
 		 880 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2815  translation initiation factor IF-2  41.26 
 
 		 883 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>