More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6884 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6884  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 285 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3557  extracellular solute-binding protein family 3  51.72 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.838933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9353  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein, putative  54.18 
 
 		 286 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5107  extracellular solute-binding protein  52.52 
 
 		 286 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3098  extracellular solute-binding protein family 3  51.79 
 
 		 293 aa  258  9e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2775  extracellular solute-binding protein family 3  48.33 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4575  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0757  extracellular solute-binding protein  46.53 
 
 		 291 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.953109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0875  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  36.96 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00496425  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2804  extracellular solute-binding protein family 3  31.6 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  32.82 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0661  extracellular solute-binding protein family 3  30.4 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000289878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  30.08 
 
 		 246 aa  85.5  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3149  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  31.02 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.66 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  28.16 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  30.18 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.77 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  28.68 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  30.48 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4039  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.1 
 
 		 503 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.47 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  28.15 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  29.84 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.18 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.18 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  32.13 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  30.67 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.38 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0907  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.44 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.455944  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  30.51 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.77 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  30.64 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.22 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3102  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  30.22 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.89 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  28.27 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  29.25 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  29.78 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  29.05 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  29.78 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  32.33 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  28.22 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  27.6 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3756  extracellular solute-binding protein family 3  29.22 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.720347  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.59 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.13 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0395  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.99 
 
 		 273 aa  72  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.95 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4365  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.74 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.74 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  30.12 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  29.66 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  26.27 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.74 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  28.46 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.12 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  32.12 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.74 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.12 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.74 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7637  extracellular solute-binding protein, family 3  26.57 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.74 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.74 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  26.99 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  29.31 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>