More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3557 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3557  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
290 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.838933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9353  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein, putative  70.47 
 
 
286 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2775  extracellular solute-binding protein family 3  57.56 
 
 
294 aa  319  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4575  extracellular solute-binding protein  57.99 
 
 
297 aa  299  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0757  extracellular solute-binding protein  59.59 
 
 
291 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.953109  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3098  extracellular solute-binding protein family 3  56.4 
 
 
293 aa  279  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6884  extracellular solute-binding protein family 3  52.61 
 
 
285 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5107  extracellular solute-binding protein  42.96 
 
 
286 aa  209  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0875  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  41.85 
 
 
287 aa  177  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00496425  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2804  extracellular solute-binding protein family 3  34.48 
 
 
276 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0661  extracellular solute-binding protein family 3  33.19 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000289878  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  32.9 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3149  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 
281 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  34.03 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  32.77 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7637  extracellular solute-binding protein, family 3  30.21 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  31.62 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 
259 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  32.21 
 
 
247 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.34 
 
 
256 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  30.77 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.64 
 
 
503 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4039  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1539  extracellular solute-binding protein family 3  30.1 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.76 
 
 
513 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3756  extracellular solute-binding protein family 3  30.93 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.720347  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  31.06 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  28.77 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4079  extracellular solute-binding protein family 3  30.08 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.711512  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  30.25 
 
 
266 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
247 aa  82  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.97 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  31.56 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.56 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  28.52 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0395  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
267 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.33 
 
 
503 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.34 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0463  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11360  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  28.63 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144563  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.57 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.57 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.14 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.99 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.06 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.99 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  26.99 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  28.57 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  28.57 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  28.57 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  29.41 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3102  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  30.08 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  27.43 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
276 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1459  extracellular solute-binding protein family 3  31.08 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  25.81 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.99 
 
 
276 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  28.21 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.64 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  26.64 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  32.56 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.64 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.64 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_003296  RS00359  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.06 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.580904  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  28.21 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  28.09 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.14 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  28.21 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  28.21 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  31.02 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.14 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  28.17 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.17 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  27.56 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0910  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31827  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  26.75 
 
 
501 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  28.99 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.33 
 
 
257 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.59 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>