More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7637 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7637  extracellular solute-binding protein, family 3  100 
 
 
290 aa  588  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3149  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2804  extracellular solute-binding protein family 3  38.34 
 
 
276 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0661  extracellular solute-binding protein family 3  38.49 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000289878  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  34.93 
 
 
281 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.8 
 
 
250 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.8 
 
 
250 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.8 
 
 
250 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.8 
 
 
250 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.8 
 
 
250 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.8 
 
 
250 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.8 
 
 
250 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.41 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.93 
 
 
250 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.93 
 
 
250 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.84 
 
 
253 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2775  extracellular solute-binding protein family 3  32.34 
 
 
294 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.93 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3557  extracellular solute-binding protein family 3  33.5 
 
 
290 aa  92.8  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.838933 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 
253 aa  90.1  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 
254 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0875  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  29.62 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00496425  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  28.1 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0757  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.953109  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3098  extracellular solute-binding protein family 3  28.99 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  31 
 
 
252 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  31.79 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  30.49 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  30.88 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  28.99 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9353  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein, putative  28.37 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.06 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.25 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.02 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.02 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.02 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  26.37 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  28.14 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.23 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2829  extracellular solute-binding protein family 3  27.34 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479003 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3410  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.09 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  26.98 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.64 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.64 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.64 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.64 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.64 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2280  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.88 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  28.57 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  27.98 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  27.98 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  27.98 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  27.98 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  27.98 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.64 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  27.45 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.64 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.64 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.64 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  30.64 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.64 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.64 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3756  extracellular solute-binding protein family 3  31.55 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.720347  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.64 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  27.8 
 
 
502 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  27.98 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  27.98 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  27.98 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  27.98 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  27.8 
 
 
502 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.06 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.34 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.34 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.07 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4575  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  31.58 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  27.38 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.06 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  27.38 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.99 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0326  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  27.98 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.34 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0463  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>