More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2775 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2775  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
294 aa  588  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3557  extracellular solute-binding protein family 3  57.58 
 
 
290 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.838933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9353  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein, putative  58.06 
 
 
286 aa  295  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0757  extracellular solute-binding protein  58.37 
 
 
291 aa  295  7e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.953109  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3098  extracellular solute-binding protein family 3  53.23 
 
 
293 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4575  extracellular solute-binding protein  54.85 
 
 
297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6884  extracellular solute-binding protein family 3  50.4 
 
 
285 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5107  extracellular solute-binding protein  42.34 
 
 
286 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0875  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  41.03 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00496425  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2804  extracellular solute-binding protein family 3  34.45 
 
 
276 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0661  extracellular solute-binding protein family 3  34.78 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000289878  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3149  extracellular solute-binding protein  34.03 
 
 
281 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7637  extracellular solute-binding protein, family 3  32.19 
 
 
290 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
281 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 
294 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 
287 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 
249 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  29.76 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.06 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.06 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.06 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.42 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.4 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.58 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  29.87 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.99 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  32.98 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24310  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  29.58 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 
264 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.29 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  29.29 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  31.65 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.51 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  31.69 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.35 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.39 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  31.28 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.1 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.1 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.1 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  28.1 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  28.1 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.92 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.1 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.94 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3102  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.65 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.92 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.92 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.74 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.93 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  29.96 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.63 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  31.25 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.74 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0592  extracellular solute-binding protein family 3  27.76 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2829  extracellular solute-binding protein family 3  28.85 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479003 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11360  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  29.06 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144563  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  31.25 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.74 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  28.94 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1402  extracellular solute-binding protein family 3  32.76 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16775  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.36 
 
 
503 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  31.51 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  31.51 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.22 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  27.73 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  31.51 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>