More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6554 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6554  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 159 aa  298  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  72.54 
 
 		 157 aa  194  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  57.24 
 
 		 170 aa  140  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  61.81 
 
 		 169 aa  131  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  55.48 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  54.11 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  62.9 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  55.17 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  55.2 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  65.19 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  50.86 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  60.53 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  55.07 
 
 		 178 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  56.72 
 
 		 148 aa  117  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  54.79 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  55.17 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  45.29 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  49.3 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  51.59 
 
 		 173 aa  107  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  59.66 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  56.52 
 
 		 168 aa  104  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  58.7 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  56.12 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  52.08 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  55.08 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  48.41 
 
 		 211 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  48.41 
 
 		 195 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  62 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  54.63 
 
 		 207 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  55.32 
 
 		 148 aa  94  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  44.44 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  54.84 
 
 		 205 aa  90.5  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  47.48 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  45.11 
 
 		 160 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  41.61 
 
 		 188 aa  86.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  58.7 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  43.51 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  58.7 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  58.7 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  40.27 
 
 		 190 aa  85.1  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  41.04 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  40.94 
 
 		 141 aa  84.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  42.86 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  41.3 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  39.55 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  59.62 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  38.81 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  38.81 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  38.41 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  38.81 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.81 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  34.35 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  36.5 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  38.81 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.81 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  34.35 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  32.12 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.06 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  41.3 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  35.97 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  32.61 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  39.26 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  34.56 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  33.57 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  44.09 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  30.94 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  37.41 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  37.59 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  29.32 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  32.81 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  32.81 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  36.73 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  38.05 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  39.13 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  36.57 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  38.05 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  48.57 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  39.69 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  37.5 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  38.76 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  35.82 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  36.09 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  42.45 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  38.81 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  38.98 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  40.38 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  35.51 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  36.03 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  35.94 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  31.69 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  35 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  34.62 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17521  ATPase or kinase  33.85 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  38.93 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  30.56 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  37.21 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  34.58 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>