More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1498 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  100 
 
 		 300 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  64.96 
 
 		 288 aa  321  9.000000000000001e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  51.38 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  45.03 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  43.54 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  43.2 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  42.91 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  44.59 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  48.81 
 
 		 293 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  48.12 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  41.5 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  40.13 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  41.45 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  33.55 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  46.88 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  40.41 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  35.02 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  34.77 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  32.76 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  32.32 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  32.3 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  35.09 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  37.4 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  31.55 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  37.13 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  33.44 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  35.23 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  34.23 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  32.35 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  34.09 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  32.1 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  34.73 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  36.5 
 
 		 337 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  33.33 
 
 		 333 aa  99.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  30.53 
 
 		 328 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  34.48 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  34.42 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  34.42 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  29.55 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  27.45 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  32.82 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  35.04 
 
 		 337 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  33.08 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  35.5 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  27.12 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  34.43 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  32.26 
 
 		 347 aa  95.9  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  32.65 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  33.33 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  32.67 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  30.17 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  34.69 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  26.67 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  30.59 
 
 		 313 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  32.67 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  26.27 
 
 		 327 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  27.06 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  29.46 
 
 		 330 aa  92.8  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  35.61 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  31.72 
 
 		 341 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  32.12 
 
 		 302 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  33.33 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  32.78 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  36.52 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  31.7 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  31.27 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.92 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.92 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.92 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  30.3 
 
 		 307 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  30.87 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  34.09 
 
 		 345 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  33.81 
 
 		 360 aa  89  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  28 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.68 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  27.34 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  33.46 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  29.15 
 
 		 314 aa  86.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  33.12 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  32.79 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  29.12 
 
 		 330 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  31.95 
 
 		 337 aa  85.5  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  32.84 
 
 		 301 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  29.12 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  29.45 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  33.44 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  31.29 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  29.51 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  29.51 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  35.66 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  30.3 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  28.77 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  32.66 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.9 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  33.33 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  33.01 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  34.17 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>