More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2838 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2327  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  97.73 
 
 
528 aa  957    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.356993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2838  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
528 aa  1032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.207275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2110  RND efflux system outer membrane lipoprotein  65.6 
 
 
520 aa  578  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277325  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3369  RND efflux system outer membrane lipoprotein  54.44 
 
 
489 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413443  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  50.98 
 
 
492 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1416  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  50.39 
 
 
469 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  51 
 
 
487 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.8 
 
 
470 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  48.42 
 
 
491 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  49.12 
 
 
474 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  48.9 
 
 
517 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  48.42 
 
 
474 aa  425  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  48.39 
 
 
512 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47 
 
 
474 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.36 
 
 
477 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.1 
 
 
484 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  44.79 
 
 
485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.44 
 
 
475 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  44.6 
 
 
485 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.59 
 
 
489 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  49.23 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.13 
 
 
486 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.58 
 
 
478 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.61 
 
 
484 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3836  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.98 
 
 
471 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232227  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  43.13 
 
 
486 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.75 
 
 
484 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  43.81 
 
 
499 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 
484 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2864  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.44 
 
 
468 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0383351  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.73 
 
 
477 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.19 
 
 
486 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.02 
 
 
500 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1737  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  43.2 
 
 
497 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746142  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.13 
 
 
469 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3678  outer membrane efflux protein  42.48 
 
 
469 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0849669  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.01 
 
 
467 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296212  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.89 
 
 
501 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.82 
 
 
470 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.11 
 
 
476 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1337  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.05 
 
 
471 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.39 
 
 
546 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.8 
 
 
516 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.24 
 
 
499 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.92 
 
 
489 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3466  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.8 
 
 
461 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.31 
 
 
485 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.9 
 
 
495 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.31 
 
 
481 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.19 
 
 
480 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2896  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.49 
 
 
477 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.8 
 
 
472 aa  369  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2869  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.57 
 
 
480 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451085  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.71 
 
 
472 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  45.36 
 
 
492 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.32 
 
 
482 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.74 
 
 
465 aa  356  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2477  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.04 
 
 
484 aa  355  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6465  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.85 
 
 
475 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0283455 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5965  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.24 
 
 
475 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5601  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.24 
 
 
475 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.89 
 
 
483 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.33 
 
 
499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4833  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.84 
 
 
474 aa  354  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.820871  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1884  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.92 
 
 
464 aa  346  5e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0017284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2756  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.85 
 
 
469 aa  345  8e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0415066  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0389  outer membrane protein OprM  39.14 
 
 
485 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.303382  hitchhiker  0.0000297498 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1392  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.08 
 
 
619 aa  343  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0995  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.4 
 
 
619 aa  343  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.26 
 
 
493 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0506  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.4 
 
 
619 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.824568  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2309  outer membrane efflux protein  43.4 
 
 
619 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.650756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1081  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.21 
 
 
619 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566614  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.46 
 
 
505 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  38.83 
 
 
460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 
503 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0381  outer membrane protein OprM  38.75 
 
 
485 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  39.03 
 
 
460 aa  340  5e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  38.83 
 
 
460 aa  339  7e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0383  outer membrane protein OprM  38.55 
 
 
485 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0443  outer membrane efflux protein OprA  38.26 
 
 
485 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.340499  hitchhiker  0.0000000156404 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0403  outer membrane protein OprM  38.55 
 
 
485 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6990  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.67 
 
 
479 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0598431  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1154  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.64 
 
 
501 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.039626  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  38.6 
 
 
457 aa  335  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.79 
 
 
457 aa  335  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  38.6 
 
 
457 aa  335  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  38.79 
 
 
457 aa  333  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3584  outer membrane protein oprM  42.09 
 
 
468 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.09 
 
 
468 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  38.79 
 
 
457 aa  333  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4008  outer membrane protein oprM  42.09 
 
 
468 aa  334  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.23 
 
 
496 aa  333  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2544  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.5 
 
 
467 aa  333  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109213  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.03 
 
 
507 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.47 
 
 
510 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.54 
 
 
507 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.85 
 
 
467 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.33 
 
 
507 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.33 
 
 
507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>