More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1949 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  100 
 
 		 612 aa  1185    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  42.9 
 
 		 664 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  41.57 
 
 		 642 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  41.45 
 
 		 626 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  40.32 
 
 		 652 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  36.99 
 
 		 624 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  37.4 
 
 		 606 aa  361  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  44.78 
 
 		 476 aa  345  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  46.84 
 
 		 512 aa  339  7e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 		 686 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 		 848 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  46.29 
 
 		 678 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  44.3 
 
 		 464 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  44.3 
 
 		 464 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  44.3 
 
 		 417 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  43.83 
 
 		 475 aa  302  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  47.07 
 
 		 614 aa  290  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  47.06 
 
 		 596 aa  289  9e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.08 
 
 		 532 aa  289  1e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  43.34 
 
 		 616 aa  289  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  43.63 
 
 		 632 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  38.21 
 
 		 683 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 654 aa  283  6.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  44.24 
 
 		 673 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  47.34 
 
 		 678 aa  281  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  45.53 
 
 		 656 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  33.71 
 
 		 698 aa  273  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.24 
 
 		 656 aa  273  8.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  37.26 
 
 		 626 aa  272  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  43.36 
 
 		 604 aa  272  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  41.85 
 
 		 509 aa  272  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.97 
 
 		 630 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  43.36 
 
 		 636 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.38 
 
 		 573 aa  271  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  38.25 
 
 		 635 aa  269  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  34.42 
 
 		 628 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  36.56 
 
 		 664 aa  267  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 		 650 aa  264  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  37.7 
 
 		 615 aa  259  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  41.48 
 
 		 537 aa  258  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  39.45 
 
 		 492 aa  257  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  39.19 
 
 		 465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  48.55 
 
 		 450 aa  171  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  39.39 
 
 		 216 aa  130  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  40.51 
 
 		 219 aa  130  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  31 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 		 433 aa  120  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 		 393 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 433 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  30 
 
 		 433 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  31.17 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  31.17 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 		 399 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  31.17 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  31.17 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  30.74 
 
 		 433 aa  115  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  33.44 
 
 		 431 aa  107  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 395 aa  106  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 471 aa  105  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 549 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 		 483 aa  100  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 505 aa  98.6  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.35 
 
 		 644 aa  97.4  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 425 aa  97.1  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 501 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 		 501 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 		 509 aa  94  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  31.32 
 
 		 520 aa  94  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.32 
 
 		 505 aa  94  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 		 501 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  31.32 
 
 		 662 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 501 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 546 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 		 475 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 		 475 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 		 494 aa  90.9  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  29.39 
 
 		 633 aa  90.9  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 476 aa  90.1  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 509 aa  89  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 		 523 aa  88.2  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  26.42 
 
 		 435 aa  87.4  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 		 435 aa  87  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 		 508 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 509 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 		 520 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  29.1 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 806 aa  82  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 		 752 aa  80.9  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 468 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  27.27 
 
 		 469 aa  80.1  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.04 
 
 		 1099 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 1118 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  26.3 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>