More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0165 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0165  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 
221 aa  221  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
224 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.75 
 
 
221 aa  221  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.97 
 
 
230 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.5 
 
 
222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.5 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.55 
 
 
224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.55 
 
 
224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.55 
 
 
226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2632  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 
217 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.7 
 
 
224 aa  211  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.76 
 
 
219 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.87 
 
 
232 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  50.5 
 
 
224 aa  208  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.74 
 
 
214 aa  208  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.24 
 
 
214 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.24 
 
 
214 aa  208  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.24 
 
 
214 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.24 
 
 
214 aa  208  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.24 
 
 
214 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.24 
 
 
214 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.24 
 
 
214 aa  208  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.01 
 
 
221 aa  207  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.24 
 
 
214 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 
218 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.24 
 
 
214 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.54 
 
 
221 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.25 
 
 
221 aa  205  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.24 
 
 
214 aa  204  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.28 
 
 
222 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0977  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.5 
 
 
219 aa  202  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 
235 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.99 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.47 
 
 
220 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.24 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.23 
 
 
221 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.72 
 
 
221 aa  199  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.01 
 
 
235 aa  199  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.79 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47 
 
 
224 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1281  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.57 
 
 
214 aa  198  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1306  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.57 
 
 
214 aa  198  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0153242  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.47 
 
 
225 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.23 
 
 
211 aa  197  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.75 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.74 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.47 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0712  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.48 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.29 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2874  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.5 
 
 
224 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.51 
 
 
238 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.73 
 
 
221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.78 
 
 
234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.78 
 
 
234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.72 
 
 
216 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2395  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.37 
 
 
221 aa  194  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.98 
 
 
221 aa  194  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 
225 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.76 
 
 
234 aa  194  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0469  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.98 
 
 
221 aa  193  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08281  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.48 
 
 
251 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.43124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.73 
 
 
218 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08261  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.91 
 
 
252 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.74 
 
 
225 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0774  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.91 
 
 
252 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.53 
 
 
264 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.75 
 
 
233 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
225 aa  191  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
225 aa  191  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.81 
 
 
225 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.02 
 
 
227 aa  191  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.06 
 
 
220 aa  190  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2075  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.26 
 
 
224 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.09 
 
 
225 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.27 
 
 
221 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08171  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.61 
 
 
251 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.96 
 
 
227 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.18 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0049  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.22 
 
 
222 aa  189  4e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  43 
 
 
221 aa  189  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.6 
 
 
225 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.89 
 
 
224 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.77 
 
 
229 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.54 
 
 
219 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  46.04 
 
 
265 aa  188  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.11 
 
 
228 aa  188  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.23 
 
 
223 aa  188  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.55 
 
 
227 aa  187  8e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0827  ribulose-phosphate 3-epimerase  49 
 
 
225 aa  187  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.66 
 
 
227 aa  187  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0172  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.04 
 
 
250 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.468732  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0082  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.72 
 
 
228 aa  187  1e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.27 
 
 
230 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08041  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.04 
 
 
250 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0416891  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.69 
 
 
223 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1649  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.36 
 
 
221 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.69 
 
 
223 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  47 
 
 
223 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>