More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3760 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  100 
 
 
273 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  97.44 
 
 
273 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  97.07 
 
 
273 aa  524  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  81.62 
 
 
273 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.75 
 
 
279 aa  391  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.58 
 
 
272 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  67.04 
 
 
277 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.5 
 
 
275 aa  354  8.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.47 
 
 
284 aa  350  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  61.9 
 
 
298 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  63 
 
 
293 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.73 
 
 
284 aa  348  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  61.54 
 
 
293 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  62.27 
 
 
291 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.73 
 
 
289 aa  342  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.99 
 
 
284 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  60.07 
 
 
271 aa  338  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.99 
 
 
289 aa  338  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  60.66 
 
 
272 aa  335  7e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  57.09 
 
 
269 aa  332  4e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  56.34 
 
 
269 aa  329  3e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  60.89 
 
 
285 aa  329  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  62.32 
 
 
278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.62 
 
 
284 aa  325  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  61.45 
 
 
275 aa  322  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  57.88 
 
 
280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.93 
 
 
290 aa  311  9e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  57.2 
 
 
282 aa  310  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  55.93 
 
 
284 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  58.09 
 
 
274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  53.48 
 
 
274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  55.56 
 
 
284 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  55.56 
 
 
284 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  54.24 
 
 
281 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  54.41 
 
 
274 aa  295  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  56.46 
 
 
281 aa  295  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  54.38 
 
 
274 aa  294  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  56.46 
 
 
284 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  54.69 
 
 
285 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  54.69 
 
 
285 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  54.69 
 
 
285 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  55.15 
 
 
274 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  54.04 
 
 
274 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  51.66 
 
 
286 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  50.72 
 
 
295 aa  269  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 
296 aa  262  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  47.62 
 
 
289 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 
287 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  43.36 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
292 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 
287 aa  186  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  41.57 
 
 
263 aa  182  8.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
246 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
246 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
246 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
246 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
235 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.2 
 
 
241 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.87 
 
 
238 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 
295 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
253 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
268 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
287 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
262 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  26.36 
 
 
236 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 
293 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
295 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
309 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
295 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
295 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
288 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.45 
 
 
247 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
254 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
252 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.36 
 
 
258 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
257 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.64 
 
 
257 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
254 aa  99.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
248 aa  99  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
268 aa  99  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3859  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.28 
 
 
259 aa  98.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.64 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.38 
 
 
249 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.9 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.522598  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.9 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.67 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
249 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.85 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>