180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2940 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2940  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  940    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3026  hypothetical protein  86.29 
 
 
473 aa  781    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.443921  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5078  hypothetical protein  44.21 
 
 
422 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2216  hypothetical protein  35.86 
 
 
547 aa  239  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3404  hypothetical protein  31.98 
 
 
500 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.552289  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  39.56 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  46.15 
 
 
357 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  37.93 
 
 
383 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  32.69 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  32.81 
 
 
459 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  32.81 
 
 
459 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  32.81 
 
 
459 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  42.31 
 
 
304 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  38.37 
 
 
365 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  42.31 
 
 
304 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  29.19 
 
 
594 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  27.89 
 
 
613 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  34.69 
 
 
345 aa  54.7  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  44.62 
 
 
352 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  29.94 
 
 
607 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  32.54 
 
 
343 aa  53.5  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  44.62 
 
 
352 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  44.64 
 
 
390 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  37.5 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  33.67 
 
 
345 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  51.02 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  40.85 
 
 
346 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  44.23 
 
 
369 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  29.63 
 
 
598 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  43.08 
 
 
352 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  41.67 
 
 
464 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  30.07 
 
 
616 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  38.27 
 
 
336 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
371 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  41.77 
 
 
342 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  38.04 
 
 
390 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  40.74 
 
 
431 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  42.86 
 
 
353 aa  50.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  43.66 
 
 
377 aa  50.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  37.33 
 
 
330 aa  50.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  40.45 
 
 
466 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  40.45 
 
 
466 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  39.47 
 
 
330 aa  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  40.45 
 
 
466 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  40.45 
 
 
466 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  40.45 
 
 
466 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  37.5 
 
 
369 aa  50.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  43.1 
 
 
427 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  43.1 
 
 
427 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  41.82 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  43.84 
 
 
473 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  38.16 
 
 
384 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  37.36 
 
 
365 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  40.45 
 
 
463 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  32.22 
 
 
353 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  39.47 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  27.08 
 
 
361 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  41.89 
 
 
306 aa  48.9  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  37.68 
 
 
377 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  39.47 
 
 
333 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  39.47 
 
 
333 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  29.13 
 
 
339 aa  49.3  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  30.4 
 
 
351 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  40 
 
 
431 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  26.77 
 
 
471 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  41.89 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  33.7 
 
 
360 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  38.14 
 
 
361 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  28.8 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  39.33 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  39.33 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  27.52 
 
 
341 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  39.33 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1585  cytochrome-c peroxidase  30.16 
 
 
397 aa  48.5  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.33 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.33 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  39.73 
 
 
322 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  38.16 
 
 
333 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  31.82 
 
 
340 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  39.33 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.33 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  26.19 
 
 
399 aa  48.5  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  38.03 
 
 
346 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  42.86 
 
 
522 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  38.55 
 
 
358 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  35.21 
 
 
352 aa  47.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  41.89 
 
 
314 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  35.23 
 
 
768 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3918  cytoChrome-c peroxidase  40.48 
 
 
98 aa  47.4  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  35.44 
 
 
398 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  38.27 
 
 
626 aa  47.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  29.49 
 
 
626 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  46.94 
 
 
401 aa  47.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 
350 aa  47.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  30.91 
 
 
390 aa  47  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  40.91 
 
 
302 aa  47  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  27.11 
 
 
594 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  38.16 
 
 
344 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  40.91 
 
 
451 aa  47  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  38.16 
 
 
344 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>