154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3918 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  98.98 
 
 		 465 aa  204  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  98.98 
 
 		 465 aa  204  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  98.98 
 
 		 465 aa  204  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  98.98 
 
 		 465 aa  204  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  98.98 
 
 		 465 aa  204  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  98.98 
 
 		 465 aa  204  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  98.98 
 
 		 465 aa  204  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3918  cytoChrome-c peroxidase  100 
 
 		 98 aa  202  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  90.32 
 
 		 466 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  90.32 
 
 		 466 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  90.32 
 
 		 466 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  90.32 
 
 		 466 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  90.32 
 
 		 466 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  83.87 
 
 		 463 aa  164  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  54.17 
 
 		 459 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  54.17 
 
 		 459 aa  104  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  54.17 
 
 		 459 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  59.74 
 
 		 322 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  58.75 
 
 		 317 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  61.33 
 
 		 304 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  61.33 
 
 		 304 aa  96.7  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  53.26 
 
 		 464 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  54.26 
 
 		 473 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  57.53 
 
 		 306 aa  87.4  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  53.09 
 
 		 314 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  55.7 
 
 		 328 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  52.5 
 
 		 437 aa  84  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  54.67 
 
 		 343 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  48.86 
 
 		 346 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  51.9 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  44.44 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  52.56 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  49.43 
 
 		 346 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  56.16 
 
 		 352 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  45 
 
 		 351 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  53.52 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1755  Cytochrome-c peroxidase  46.75 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138624  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  45.45 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  47.73 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  47.44 
 
 		 353 aa  71.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  50.7 
 
 		 352 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  49.3 
 
 		 333 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  50 
 
 		 345 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  45.45 
 
 		 333 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  46.59 
 
 		 333 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  46.59 
 
 		 333 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  45.35 
 
 		 334 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  49.3 
 
 		 333 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  46.59 
 
 		 330 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  50.7 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  45.45 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02450  hypothetical protein  45.45 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  50.7 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  50.67 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  50.68 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  46.59 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  45.56 
 
 		 459 aa  68.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  45.35 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  46.59 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  48.05 
 
 		 377 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  46.59 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  45.45 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  46.59 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2106  cytochrome-c peroxidase  60.34 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  47.89 
 
 		 352 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  49.3 
 
 		 371 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4384  cytochrome-c peroxidase  55.17 
 
 		 332 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  43.18 
 
 		 345 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  45 
 
 		 346 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000355  cytochrome c551 peroxidase  45.21 
 
 		 325 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  45.83 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  46.15 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  47.89 
 
 		 331 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  47.95 
 
 		 346 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  46.48 
 
 		 384 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  44 
 
 		 397 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  49.3 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  47.3 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1585  cytochrome-c peroxidase  49.18 
 
 		 397 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  45.95 
 
 		 349 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  47.3 
 
 		 346 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  44.16 
 
 		 340 aa  64.7  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  43.59 
 
 		 347 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  43.18 
 
 		 330 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  43.59 
 
 		 347 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  43.84 
 
 		 350 aa  63.5  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  43.24 
 
 		 330 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00242  cytochrome C peroxidase  55.36 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3903  Cytochrome-c peroxidase  51.72 
 
 		 309 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  43.24 
 
 		 359 aa  60.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  42.86 
 
 		 347 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  44.59 
 
 		 345 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  37.65 
 
 		 365 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06168  cytochrome c551 peroxidase  40.28 
 
 		 323 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  50 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  46.43 
 
 		 344 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  38.89 
 
 		 324 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  38.54 
 
 		 365 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  36.26 
 
 		 626 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  45 
 
 		 338 aa  52.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>