171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02450 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02450  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  231  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  67.89 
 
 		 333 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  67.89 
 
 		 330 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  67.89 
 
 		 344 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  67.89 
 
 		 344 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  67.89 
 
 		 344 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  67.89 
 
 		 344 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  66.06 
 
 		 333 aa  160  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  66.06 
 
 		 333 aa  160  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  66.06 
 
 		 333 aa  160  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  66.97 
 
 		 333 aa  160  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  65.14 
 
 		 330 aa  153  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  62.39 
 
 		 330 aa  152  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  59.26 
 
 		 339 aa  141  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  59.26 
 
 		 331 aa  137  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  55.56 
 
 		 371 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  57.01 
 
 		 342 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  56.88 
 
 		 353 aa  134  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  54.13 
 
 		 333 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  55.56 
 
 		 355 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  54.63 
 
 		 352 aa  130  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  55.56 
 
 		 333 aa  130  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  53.21 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  54.63 
 
 		 331 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  51.85 
 
 		 352 aa  122  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  56.12 
 
 		 351 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  50.93 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  56.7 
 
 		 352 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  51.79 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  51.35 
 
 		 358 aa  110  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  54.74 
 
 		 345 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1755  Cytochrome-c peroxidase  53.06 
 
 		 386 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  53.76 
 
 		 346 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  50.45 
 
 		 349 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  50.45 
 
 		 350 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  50.45 
 
 		 347 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  48.42 
 
 		 345 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  50.54 
 
 		 346 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  49.46 
 
 		 346 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  48.21 
 
 		 347 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  48.21 
 
 		 347 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  48.42 
 
 		 345 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  48.65 
 
 		 359 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  52.48 
 
 		 346 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  45.95 
 
 		 346 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  45.95 
 
 		 346 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  49.46 
 
 		 348 aa  95.9  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  49 
 
 		 322 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  46.49 
 
 		 397 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  45.05 
 
 		 340 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  52.87 
 
 		 357 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  48.75 
 
 		 344 aa  87.8  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  46.25 
 
 		 341 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  46.25 
 
 		 341 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  46 
 
 		 464 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  42.5 
 
 		 344 aa  85.1  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  46.67 
 
 		 343 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  47.78 
 
 		 304 aa  83.6  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  47.78 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  45.24 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  46.25 
 
 		 338 aa  82  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  47.25 
 
 		 377 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  44.21 
 
 		 437 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  44.05 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  47.87 
 
 		 314 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  45.36 
 
 		 351 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  44.3 
 
 		 342 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  45.26 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0370  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  42.5 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  47.78 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  42.86 
 
 		 317 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  42.71 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  47.13 
 
 		 330 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  43.75 
 
 		 332 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  40.91 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4384  cytochrome-c peroxidase  42.22 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000355  cytochrome c551 peroxidase  41.49 
 
 		 325 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3918  cytoChrome-c peroxidase  45.45 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  42.86 
 
 		 465 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  42.86 
 
 		 465 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  46.25 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  36.89 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  42.86 
 
 		 465 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.86 
 
 		 465 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  36.89 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  36.89 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  42.86 
 
 		 465 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.86 
 
 		 465 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.86 
 
 		 465 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1585  cytochrome-c peroxidase  54.24 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  39.56 
 
 		 463 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  40 
 
 		 473 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06168  cytochrome c551 peroxidase  38.75 
 
 		 323 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  40.2 
 
 		 466 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  40.2 
 
 		 466 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  40.2 
 
 		 466 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  40.2 
 
 		 466 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  40.2 
 
 		 466 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00242  cytochrome C peroxidase  43.48 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3903  Cytochrome-c peroxidase  37.08 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>