76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3477 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 386 aa  793    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  41.42 
 
 		 392 aa  252  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  36.46 
 
 		 375 aa  209  7e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  28.02 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2220  endoribonuclease L-PSP  27.09 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2072  pteridine-dependent deoxygenase  28.31 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  27.01 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1994  putative pteridine-dependent deoxygenase like protein  28.9 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.104515  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  30.66 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  31.43 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2681  Endoribonuclease L-PSP  29.64 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0232288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0320  hypothetical protein  36.17 
 
 		 324 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  28.94 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1054  hypothetical protein  29.15 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.974615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1999  hypothetical protein  33.58 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1331  hypothetical protein  34.23 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  27.96 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  27.96 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  34.44 
 
 		 140 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  30.77 
 
 		 130 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 131 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 147 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0997  endoribonuclease L-PSP  27.84 
 
 		 127 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4840  Endoribonuclease L-PSP  25.49 
 
 		 130 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4201  Endoribonuclease L-PSP  32.63 
 
 		 127 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0467405  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1155  endoribonuclease L-PSP family protein  26.8 
 
 		 127 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1077  Endoribonuclease L-PSP  28.87 
 
 		 130 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0180844  normal  0.0247338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  26.92 
 
 		 138 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1582  endoribonuclease L-PSP  30.93 
 
 		 128 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 135 aa  50.4  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  28.43 
 
 		 145 aa  50.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  28.28 
 
 		 138 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03739  xanthomonadin biosynthesis pteridine-dependent deoxygenase like protein  28.99 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  29.59 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  26.92 
 
 		 139 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  25.96 
 
 		 138 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1736  endoribonuclease L-PSP  27.84 
 
 		 130 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2055  Endoribonuclease L-PSP  27.84 
 
 		 130 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  26.21 
 
 		 130 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 132 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  28.16 
 
 		 145 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  26.79 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  27.27 
 
 		 136 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  28.28 
 
 		 140 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  28.28 
 
 		 140 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 128 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  24.74 
 
 		 128 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  25.73 
 
 		 353 aa  47.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 140 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 149 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 143 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  46.2  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  26.26 
 
 		 144 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  28.16 
 
 		 145 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  27.18 
 
 		 145 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  26.26 
 
 		 138 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  27.18 
 
 		 145 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  24.74 
 
 		 127 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 118 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  30.86 
 
 		 149 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 127 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  29.59 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  27.97 
 
 		 128 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 130 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  30.39 
 
 		 126 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 145 aa  43.9  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 126 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  28 
 
 		 130 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 140 aa  43.1  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 133 aa  42.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2385  Endoribonuclease L-PSP  30.61 
 
 		 128 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094696  hitchhiker  0.000676577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 140 aa  43.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  32.39 
 
 		 129 aa  42.7  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>