More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2957 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 697 aa  1362    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2437  sensor histidine kinase  30.83 
 
 		 704 aa  256  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2672  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 659 aa  250  7e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0528368  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 711 aa  247  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1598  histidine kinase  32.75 
 
 		 689 aa  247  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0703  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 703 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 688 aa  243  9e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 693 aa  239  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3103  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 688 aa  238  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1534  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 688 aa  234  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.887236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3440  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 708 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184047  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0158  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 684 aa  230  7e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0750  signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 680 aa  219  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0949  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 706 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.317535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3296  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 672 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.593293  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 694 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1998  Signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 694 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.689731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 712 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5031  sensor histidine kinase  25.6 
 
 		 677 aa  178  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2444  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 695 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1993  histidine kinase  27.64 
 
 		 696 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.124604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 690 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0429  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 690 aa  168  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0815441 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2439  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 690 aa  160  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2325  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 681 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136199  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03285  sensor histidine kinase  24.58 
 
 		 675 aa  153  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2196  histidine kinase  30.2 
 
 		 684 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1941  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 677 aa  151  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0661  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 686 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3043  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 678 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0849  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 701 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  30.17 
 
 		 517 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2206  histidine kinase  30.77 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 1057 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 899 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  25.94 
 
 		 524 aa  75.1  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 785 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 		 1415 aa  74.3  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  29.17 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3794  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 708 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 510 aa  73.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 491 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  36.36 
 
 		 420 aa  73.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0754  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.17 
 
 		 492 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.499334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 680 aa  72.8  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 511 aa  73.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  25.28 
 
 		 1230 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  31.43 
 
 		 617 aa  72.4  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 		 1426 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  38.53 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  29.74 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  28.87 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  26.18 
 
 		 1427 aa  71.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 		 946 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0097  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 720 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1451  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 471 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.823078  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 736 aa  70.1  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 451 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2498  histidine kinase  29.58 
 
 		 451 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.568637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  26.53 
 
 		 655 aa  69.7  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  32.81 
 
 		 1744 aa  69.7  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  28.51 
 
 		 611 aa  69.7  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 540 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1768  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 576 aa  69.3  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 577 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4196  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 		 693 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  29.69 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2387  histidine kinase  29.05 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 742 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 1646 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2532  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 		 794 aa  67.8  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.108241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 		 814 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 838 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 826 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 653 aa  67.4  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  23.5 
 
 		 581 aa  67.4  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 		 503 aa  67  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1471  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 841 aa  67  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  29.08 
 
 		 846 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 		 753 aa  67  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 501 aa  66.6  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 1224 aa  67  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2156  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 838 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 729 aa  67  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 838 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  29.08 
 
 		 835 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  30.13 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  29.08 
 
 		 835 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  29.08 
 
 		 879 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 838 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  29.08 
 
 		 835 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 1651 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06169  histidine kinase  33.06 
 
 		 1225 aa  66.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  29.08 
 
 		 885 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>