More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1816 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1816  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
590 aa  1173    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  34.01 
 
 
699 aa  248  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4675  ATPase central domain-containing protein  36.61 
 
 
720 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760219  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0808  ATPase central domain-containing protein  40.16 
 
 
715 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  39.63 
 
 
715 aa  230  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1566  AAA ATPase central domain protein  33.03 
 
 
625 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20815  hitchhiker  0.00245284 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1202  ATPase central domain-containing protein  35.58 
 
 
627 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0870142  normal  0.869838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0020  AAA ATPase, central region  30.68 
 
 
697 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1361  AAA ATPase, central region  28.57 
 
 
704 aa  206  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0194  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
619 aa  193  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223838  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.35 
 
 
685 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0985  AAA ATPase central domain protein  31.48 
 
 
683 aa  187  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0130271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  33.52 
 
 
715 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.16 
 
 
714 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.16 
 
 
696 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.41 
 
 
624 aa  184  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.68 
 
 
681 aa  183  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  31.36 
 
 
627 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.6 
 
 
697 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.37 
 
 
644 aa  182  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  30.8 
 
 
692 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  31.67 
 
 
708 aa  180  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.43 
 
 
793 aa  180  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  31.33 
 
 
760 aa  180  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.91 
 
 
623 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.38 
 
 
640 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.4 
 
 
617 aa  179  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.38 
 
 
640 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.83 
 
 
673 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37796  predicted protein  32 
 
 
636 aa  177  6e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  33.48 
 
 
618 aa  177  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_002978  WD1253  cell division protein FtsH  31.25 
 
 
613 aa  176  9e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  30.91 
 
 
605 aa  176  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  31.18 
 
 
784 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  29.4 
 
 
700 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.84 
 
 
750 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl672  cell division protein  29.88 
 
 
650 aa  176  9.999999999999999e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.88 
 
 
610 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.08 
 
 
610 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.8 
 
 
639 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.24 
 
 
676 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0128  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.09 
 
 
614 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.464101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.86 
 
 
605 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3656  AAA ATPase, central region  32.2 
 
 
694 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.07 
 
 
608 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.57 
 
 
607 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.85 
 
 
794 aa  174  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.1 
 
 
633 aa  174  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.91 
 
 
717 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.91 
 
 
713 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  29.93 
 
 
614 aa  173  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13471  predicted protein  32.77 
 
 
476 aa  173  9e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155639  normal  0.170565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.19 
 
 
655 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.95 
 
 
632 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.84 
 
 
783 aa  172  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.44 
 
 
612 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  31.51 
 
 
784 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  31.49 
 
 
783 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  30.18 
 
 
691 aa  171  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  31.49 
 
 
783 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.62 
 
 
618 aa  172  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  30.22 
 
 
883 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.46 
 
 
759 aa  171  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.24 
 
 
640 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.7 
 
 
798 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.55 
 
 
760 aa  171  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.17 
 
 
608 aa  171  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.5 
 
 
630 aa  170  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.56 
 
 
615 aa  170  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  31.69 
 
 
514 aa  170  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.79 
 
 
672 aa  170  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.64 
 
 
781 aa  170  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.73 
 
 
635 aa  170  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  29.57 
 
 
630 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.81 
 
 
615 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.09 
 
 
697 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.18 
 
 
616 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  28.96 
 
 
613 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  28.95 
 
 
499 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.52 
 
 
610 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.04 
 
 
631 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.09 
 
 
697 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.48 
 
 
601 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.48 
 
 
601 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0018  FtsH-2 peptidase  29.86 
 
 
695 aa  169  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  32.48 
 
 
616 aa  169  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  28.03 
 
 
633 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.17 
 
 
640 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.12 
 
 
657 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.51 
 
 
663 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.71 
 
 
653 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.51 
 
 
663 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.3 
 
 
621 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2457  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.54 
 
 
615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133798  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  31.44 
 
 
817 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.85 
 
 
602 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  30.99 
 
 
673 aa  167  4e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01970  ATP-dependent peptidase, putative  31.54 
 
 
782 aa  167  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.69 
 
 
628 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.64 
 
 
673 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>