148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1701 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  57.57 
 
 
311 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  49.3 
 
 
321 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  45.42 
 
 
347 aa  239  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  56.72 
 
 
326 aa  224  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.07 
 
 
319 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  45.61 
 
 
307 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.81 
 
 
381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  38.08 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.62 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  39.15 
 
 
349 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  38.61 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.76 
 
 
313 aa  105  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.99 
 
 
282 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  32.37 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  38.35 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.35 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 
297 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  34.56 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.99 
 
 
306 aa  89.4  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  35.9 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.72 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  34.15 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.89 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  38 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  33.81 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.52 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  33.19 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.95 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  33.61 
 
 
345 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  22.89 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  30.24 
 
 
308 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  33.95 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0625  hypothetical protein  32.09 
 
 
237 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  31.28 
 
 
331 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  31.28 
 
 
331 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  31.28 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37570  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  28.44 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295733  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  23.36 
 
 
292 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  23.14 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  23.36 
 
 
293 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  31.86 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  26.06 
 
 
414 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  27.08 
 
 
293 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  23.36 
 
 
293 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 
316 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  27.42 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  26.06 
 
 
395 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  28.26 
 
 
314 aa  53.1  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  28.89 
 
 
308 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.91 
 
 
317 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 
289 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  28.45 
 
 
283 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  29.72 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  44 
 
 
169 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 
295 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  29.49 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  25.2 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  24.25 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  27.56 
 
 
293 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 
295 aa  50.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  26.44 
 
 
296 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  30 
 
 
299 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  30.54 
 
 
299 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.13 
 
 
293 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  30.54 
 
 
299 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  21.81 
 
 
293 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  28.38 
 
 
316 aa  49.3  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0401  hypothetical protein  26.09 
 
 
336 aa  49.7  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  26.06 
 
 
316 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  26.44 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  24.75 
 
 
290 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  21.1 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  24.34 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  26.44 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  26.44 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  28.78 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  32.28 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  32.07 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  28.92 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
311 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  25.93 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  20.68 
 
 
294 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  26.1 
 
 
296 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  25 
 
 
297 aa  47  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  41.89 
 
 
307 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  34.52 
 
 
311 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  42.47 
 
 
308 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  41.89 
 
 
307 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  31.19 
 
 
305 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.61 
 
 
284 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.13 
 
 
274 aa  46.2  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>