260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0751 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
453 aa  890    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  35.06 
 
 
461 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  33.73 
 
 
444 aa  226  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  32.21 
 
 
448 aa  224  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  32.38 
 
 
455 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  31.94 
 
 
444 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  31.49 
 
 
458 aa  203  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  35.32 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  33.55 
 
 
454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  34.41 
 
 
454 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  34.18 
 
 
448 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3105  Pyrrolo-quinoline quinone  32.75 
 
 
453 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1165  pyrrolo-quinoline quinone  32.82 
 
 
450 aa  187  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0116757  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  30.16 
 
 
441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  31.49 
 
 
440 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  29.36 
 
 
475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.24 
 
 
393 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.69 
 
 
393 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.33 
 
 
393 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.59 
 
 
392 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.62 
 
 
393 aa  100  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  26.52 
 
 
392 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.52 
 
 
392 aa  99  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.52 
 
 
392 aa  99  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  26.52 
 
 
392 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.52 
 
 
392 aa  99  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.24 
 
 
392 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.24 
 
 
392 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.32 
 
 
392 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.32 
 
 
392 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.32 
 
 
392 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.52 
 
 
392 aa  96.7  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.32 
 
 
392 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.97 
 
 
392 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.38 
 
 
393 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.38 
 
 
393 aa  94.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.38 
 
 
393 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.16 
 
 
392 aa  94.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.76 
 
 
399 aa  94.4  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  28.86 
 
 
379 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.22 
 
 
391 aa  89.7  9e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.24 
 
 
395 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.69 
 
 
385 aa  87.8  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 
963 aa  86.7  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  25.72 
 
 
389 aa  86.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  28.16 
 
 
365 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.59 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.03 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  26.87 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  24.82 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  23.33 
 
 
384 aa  84  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  23.06 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  23.55 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.13 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  27.35 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.74 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.09 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.91 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.49 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  24.58 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.59 
 
 
402 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  28.19 
 
 
484 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_002978  WD0750  PQQ repeat-containing protein  21.53 
 
 
353 aa  79.7  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.137969  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 
795 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  25.93 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  27.44 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.08 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.92 
 
 
381 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  30.43 
 
 
363 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  25.7 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  26.92 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.37 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.19 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.11 
 
 
411 aa  79  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  27.35 
 
 
381 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  26.92 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.78 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.35 
 
 
350 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.92 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  23.73 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  28.09 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  28.09 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.42 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  31.66 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.73 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  25.94 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  25.94 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.6 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  26.92 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  26.92 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  27.12 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  26.27 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  26.92 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  26.92 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  26.92 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  26.92 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  26.92 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.37 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.37 
 
 
395 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  26.5 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>