More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3172 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
267 aa  527  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  84.35 
 
 
263 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  56.55 
 
 
282 aa  291  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  55.81 
 
 
266 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  55.85 
 
 
266 aa  270  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  53.85 
 
 
263 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  53.85 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  51.34 
 
 
267 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  49.43 
 
 
290 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  50 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  52.31 
 
 
262 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  48.85 
 
 
264 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32750  transcriptional regulator, DeoR family  45.08 
 
 
261 aa  195  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19583  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  49.45 
 
 
265 aa  195  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  48.11 
 
 
262 aa  191  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  41.87 
 
 
254 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  39.34 
 
 
266 aa  162  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3470  transcriptional regulator, DeoR family  44.81 
 
 
266 aa  158  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
267 aa  155  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  38.58 
 
 
257 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  34 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  34.35 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  42.46 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0975  LacR family lactose transport regulator  39.91 
 
 
237 aa  145  9e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  36.89 
 
 
253 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  34.73 
 
 
253 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 
254 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  38.49 
 
 
260 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  38.59 
 
 
262 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  35.66 
 
 
278 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.58 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  33.86 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 
253 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  32.92 
 
 
258 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  35.71 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
253 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
256 aa  133  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  35.18 
 
 
260 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  39.29 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  38.64 
 
 
252 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  34.54 
 
 
250 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  34.26 
 
 
255 aa  132  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
255 aa  132  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
255 aa  132  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.86 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  33.86 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  33.86 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  38.64 
 
 
252 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  38.27 
 
 
253 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  35.86 
 
 
256 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  33.05 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  36.63 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  37.08 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  35.47 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  33.2 
 
 
275 aa  126  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  36.82 
 
 
258 aa  125  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  36.29 
 
 
256 aa  125  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
285 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.65 
 
 
269 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  41.06 
 
 
253 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
249 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 
254 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
254 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
254 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  30.65 
 
 
257 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 
254 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
254 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  36.78 
 
 
257 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  35.51 
 
 
253 aa  122  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  34.76 
 
 
250 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
257 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  32.32 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  32.32 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  34.15 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  32.32 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  37.14 
 
 
256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0839  sugar metabolism transcriptional regulator  30.16 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000299847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0242  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  40.74 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  35.91 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  34.17 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.33 
 
 
258 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  32.11 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.11 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.11 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>