More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1527 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 
138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  54.55 
 
 
161 aa  155  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  54.89 
 
 
161 aa  149  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  52.9 
 
 
139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 
136 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  48.53 
 
 
137 aa  140  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  48.12 
 
 
140 aa  134  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  43.48 
 
 
139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  47.69 
 
 
138 aa  124  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  45.99 
 
 
138 aa  123  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  43.61 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  39.71 
 
 
137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  41.91 
 
 
137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  39.67 
 
 
136 aa  97.1  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  38.35 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  36.57 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  36.76 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  37.6 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  36.84 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  37.88 
 
 
131 aa  94.4  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  38.35 
 
 
160 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  33.82 
 
 
137 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  38.35 
 
 
142 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  36.03 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  38.35 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  38.35 
 
 
141 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  37.68 
 
 
146 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  37.12 
 
 
134 aa  87  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  36.09 
 
 
133 aa  87  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  34.56 
 
 
132 aa  86.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  35.88 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  37.69 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  35.61 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  36.09 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  34.56 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  32.09 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  33.09 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  35.56 
 
 
132 aa  84.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  36.84 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  35.82 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  39.69 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  37.1 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  33.08 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  38.79 
 
 
134 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  36.92 
 
 
132 aa  83.6  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  34.59 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  31.39 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  34.59 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  32.09 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  36.8 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  33.83 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  33.58 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  33.59 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  30.88 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  30.66 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  33.58 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  32.35 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  34.78 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  36.84 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  36.36 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  39.67 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  41.13 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  40 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  29.93 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  32.82 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  32.37 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  33.59 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  32.84 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  33.08 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  30.15 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  32.82 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  33.06 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  33.08 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0833  hypothetical protein  31.65 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3284  protein of unknown function UPF0047  29.93 
 
 
138 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  31.65 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  35.48 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  33.08 
 
 
132 aa  76.6  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  29.93 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  33.08 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  35.71 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1034  hypothetical protein  33.59 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0183321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7042  protein of unknown function UPF0047  35.07 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  30.66 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  32.37 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 
584 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  33.06 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0976  protein of unknown function UPF0047  31.97 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.394936  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  31.4 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  31.97 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  31.62 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  36.92 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  30.94 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  30.94 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  31.58 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  31.65 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  33.09 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0880  protein of unknown function UPF0047  31.3 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>